白绢病是大多药用植物的共性成灾病害,影响药材的产量和品质,不利于药材产业高质量发展。近日,湖北省农科院中药材所栽培团队在Scientific Data发表题为“The high-quality genome sequence of Agroathelia rolfsii (Syn. Sclerotium rolfsii), the causal agent of southern blight in Coptis chinensis” 的论文,揭示了对这一问题的最新研究进展。
论文一作者为游景茂研究员。湖北省农科院供图
该研究基于白绢病菌侵染机制不明,开展其转录组和蛋白组等分析时缺乏高质量参考基因组的问题,针对黄连白绢病菌LC1菌株进行全基因组测序,发现其基因组大小为43.3 Mb,GC 含量为46.28 %,重复序列比列为30.93%,蛋白编码基因数为8,826,预测到 22 个生物合成基因簇,包括 4 个萜类、3 个 I 型聚酮合酶(PKS)和 1 个非核糖体肽合成酶(NRPS)基因簇,同时发现已发表的不同白绢病菌菌株间基因数量差异明显,显示其基因组多样性,可能影响菌株的生态适应性、宿主特异性和致病性。
有评论认为,该基因组为解析其致病机制、宿主互作及抗病基因挖掘奠定基础,对推动靶向防控策略研发具有重要意义。
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