论文标题：Data Management in Biobanking: Strategies, Challenges, and Future Directions

论文链接：https://www.mdpi.com/2673-6284/13/3/34

期刊名：BioTech

期刊主页：https://www.mdpi.com/journal/biotech

研究背景

生物样本库作为各类生物样本及其相关数据的存储库，是生物医学研究的重要基石。生物样本库不仅为研究人员提供了丰富的生物样本资源，还提供了大量相关的数据，包括人口统计信息、医疗史和基因图谱等。这些数据集具有揭示疾病机制、识别早期诊断和预后的生物标志物以及为患者制定个性化治疗方案以改善治疗效果的潜力，其数据管理的质量也直接关系到样本资源的科学价值与可用性。来自德国Borstel研究中心的Ramez Alkhatib博士与Karoline I. Gaede博士在BioTech期刊发表了相关综述文章，系统梳理了生物样本库数据管理的现状、挑战与未来发展趋势，为全球生物样本库的高质量运行提供了理论支持与实践指南。

研究过程与结果

文章明确了生物样本库在生物医学研究中的核心地位，并指出数据管理是影响其资源价值的关键。研究聚焦于生物样本库数据管理的全流程，包括收集、存储、整合、共享、伦理与治理等。作者借助对生物样本库数据管理领域的现有文献的全面调研与分析，通过对大量现有研究进行批判性阅读、综合和归纳，构建出一个关于生物样本库数据管理的多层次、系统化的知识框架，并指出当前研究的局限性和未来亟待解决的问题。

作者首先探讨了生物样本在生物样本库中的核心作用，指出生物样本对于研究疾病背后的分子机制、识别早期疾病检测的生物标志物以及阐明潜在的治疗干预途径的重要性，同时列举出一些常见的生物样本类型。

图1. 常见生物样本

生物样本库中存储数据的多方面性在推进科学知识和医疗成果方面起着关键作用。除了传统的生物样本和相关的临床记录外，生物样本库还纳入临床数据、影像数据（如病理切片、MRI、CT）及（基因组、转录组、蛋白组、代谢组）等作为生物医学探索和临床诊断的宝贵资源。

图2.生物样本库的数据类型

文章强调有效的数据管理是释放生物样本库巨大科研潜力的先决条件。数据管理涵盖了生物样本库机构在处理、存储和有效利用数据时所面临的各种难题。作者系统总结了数据异构性、质量保障、隐私安全、伦理合规（如GDPR、HIPAA）、数据治理和长期可持续性等主要难题。并对此制定了有效数据管理策略，评估了标准化与元数据注释、质量控制流程、安全数据基础设施（如加密、访问控制）、以及数据共享与合作机制等多种管理策略的有效性。该综述指出，未来生物样本库的发展将依赖于先进技术的集成（如区块链确保数据可信与追溯、AI用于数据分析和挖掘）、长期数据可持续性规划以及对伦理与社会影响的深度关注（如动态知情同意、利益共享）。呼吁生物样本库优先考虑伦理原则、透明度和利益相关者参与，通过采用最佳实践和新兴技术，使其成为推动生物医学研究和精准医疗发展的核心力量。

研究总结

生物样本库是宝贵的生物样本和数据的存储库，对于推进生物医学研究、个性化医疗和公共卫生计划具有巨大的潜力。生物样本库中的数据管理是一项多方面的挑战，需要综合考虑技术、伦理和监管等多方面因素。本综述重点阐述了生物样本库中数据管理的关键方面，并指出需要面临的一系列重大挑战。提出拥抱开放的数据共享、合作以及对数据资源的负责任管理，能够增进信任、促进创新，并使生物样本库项目在科学发现和医疗保健服务方面发挥最大影响力。通过解决生物样本库中数据管理的复杂挑战，并接纳新兴技术和最佳实践，生物样本库能够成为生物医学研究的重要贡献者以及推动医疗保健领域变革性进步的催化剂，最终通过对宝贵生物资源的可持续利用来造福社会。

BioTech期刊介绍

https://www.mdpi.com/journal/biotech

主编：Prof. Dr. Massimo Negrini, Department of Morphology, Surgery and Experimental Medicine, University of Ferrara, Ferrara, Italy

期刊发表范围涵盖生物制药领域, 通过培育转基因植物、动物或水生生物来解决农业中食品的生产或质量问题，以及在医学领域中采用的新方法；在环境领域中的应用，旨在维护生物多样性并清除污染物；开发能够生产有用化学物质或销毁有害/污染化学物质的生物体或酶；生物信息学方法；以及与生物技术领域中的伦理、哲学和监管方面相关的论文。被ESCI、Scopus、PubMed, PMC, 等多个权威数据库收录。期刊最新影响因子 IF 3.1， CiteScore 4.8，在JCR Biotechnology and Applied Microbiology 类别 排名中位居Q2.