在国家自然科学基金等项目资助下，南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）（以下简称广州海洋实验室）研究员周文良团队与中国科学院院士魏辅文团队合作，成功揭示了南海珊瑚礁鱼类皮肤微生物群落的组装机制。相关成果近日在线发表于《国际微生物生态学通讯》（ISME Communications）。论文第一作者为广州海洋实验室的赖瀚、高阔和邱兰，通讯作者为周文良。

环境因素和宿主因素对珊瑚礁鱼类皮肤微生物群落的相对贡献。研究团队供图

鱼类皮肤作为宿主与外界环境直接接触的重要界面，其表面黏液层不仅是抵御病原微生物入侵的关键屏障，也为共生微生物提供了栖息空间。珊瑚礁鱼类物种多样、生态功能复杂，是研究宿主—微生物互作及微生物群落组装机制的理想对象。该研究以中国南海珊瑚礁鱼类为对象，基于25个采样站位的447个鱼类皮肤微生物样本，涵盖138种鱼类，分属80属、37科、7目，通过16S rRNA基因扩增子测序，系统解析了南海珊瑚礁鱼类皮肤微生物群落的多样性格局及其环境与宿主驱动机制。

研究发现，环境因素是影响珊瑚礁鱼类皮肤微生物群落结构的主要驱动因子，其对群落差异的解释贡献显著高于宿主性状、宿主系统发育距离和地理距离，其中温度和硅酸盐是关键环境因子。宿主因素同样参与皮肤微生物群落的组装过程：鱼类的迁移性、食性等性状与皮肤微生物群落差异显著相关，提示宿主生活方式可能通过影响栖息地利用、活动范围及环境微生物暴露，间接调控皮肤微生物群落结构。

研究进一步发现，珊瑚礁鱼类皮肤微生物存在微弱但显著的系统发育共生信号，即亲缘关系较近的鱼类，其皮肤微生物群落整体上更为相似。这表明，鱼类皮肤微生物群落不仅受外部环境筛选的影响，宿主的演化历史、性状特征和生活方式也可能参与微生物定殖与群落组装。总体而言，环境筛选在珊瑚礁鱼类皮肤微生物群落形成过程中占主导地位，宿主因素则可能主要通过调节宿主相关微环境及资源利用方式发挥间接作用。

该研究深化了对珊瑚礁鱼类宿主-微生物互作机制的认识，并为从微生物多样性视角评估珊瑚礁生态系统健康、制定保护管理策略提供了科学依据。

相关论文信息：https://doi.org/10.1093/ismeco/ycag121