《细胞》

小胶质细胞的体细胞变异体驱动炎症和增殖状态

美国波士顿儿童医院的Christopher A. Walsh团队探明阿尔茨海默病（AD）小胶质细胞中富集的体细胞变异体可驱动炎症和增殖状态。相关成果近日发表于《细胞》。

AD是一种小胶质细胞介导的以神经炎症为特征的神经退行性疾病。311份脑组织样本的深度组合测序显示，AD大脑中癌症驱动基因的体细胞单核苷酸变异（sSNVs）富集，特别是与克隆性造血相关的基因。这些sSNVs与克隆扩增相关，既存在于多个脑区的小胶质细胞样脑巨噬细胞中，也出现在配对外周血内，提示其大概率起源于造血系统。

来自另外62例AD和对照脑组织的单核RNA测序数据显示，AD小胶质细胞样脑巨噬细胞中，与克隆性造血相关的体细胞拷贝数变异（sCNVs）增加。而单细胞多组学分析表明，携带sSNVs和sCNVs的小胶质细胞样脑巨噬细胞表现出疾病相关小胶质细胞的炎症和增殖转录特征。

这些发现表明，小胶质细胞样脑巨噬细胞中的克隆性体细胞驱动变异体在AD患者体内富集，可能促进神经炎症和神经退行性变。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1016/j.cell.2026.03.040

多界癌症微生物群的生物多样性和生物地理学特性

美国丹娜-法伯癌症研究所的Matthew Meyerson课题组提出了多界癌症微生物群的生物多样性和生物地理学特性。5月5日，相关研究成果发表于《细胞》。

微生物是肿瘤微环境的重要组成部分，但现有报道存在矛盾，使得微生物在癌症类型中的普遍程度尚不明确，因此需要更先进的方法来表征肿瘤相关微生物组。

研究人员建立了宿主减除和分类流程，用于识别全基因组测序数据中的微生物群，并将其应用于英国10万人基因组计划的16369个高深度肿瘤全基因组数据。在去污后，大多数癌症类型的微生物特征与背景无法区分。

然而，在口腔消化系统肿瘤中，研究人员检测到多界多微生物群落，包括细菌、真菌、病毒、古菌，在某些情况下，甚至包括原生动物寄生虫——毛滴虫。这些群落因肿瘤部位和亚型而异，微卫星不稳定和聚合酶ε（POLE）/聚合酶δ （POLD1）突变肿瘤的微生物定植增加，在口腔消化系统癌症中观察到微生物负荷与肿瘤突变负荷之间的相关性。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1016/j.cell.2026.04.015

《自然-化学》

研究发现化学蛋白质组学的小分子结合位点

美国加利福尼亚大学洛杉矶分校的Keriann M. Backus团队发现了使用硅醚激活的化学蛋白质组学的小分子结合位点。近日，相关研究成果发表于《自然-化学》。

在化学探针与药物发现研究中，基于质谱的化学蛋白质组学与光亲和标记的结合，已成为靶标发现和作用机制解析的主流策略。然而，光交联产生的肽段-化合物加合物给定量结合位点的发现带来了分析上的挑战。

研究人员建立了“硅醚赋能化学蛋白质组相互作用与靶标结合”（SEE-CITE）方法。SEE-CITE引入了一种全功能化的可化学裂解的光交联手柄，能够实现标记位点的精准鉴定，并对不同化学结构化合物的相对结合位点进行比较。

研究人员对FragPipe计算平台中的MSFragger算法进行了扩展，使其能够针对光亲和标记和SEE-CITE数据输出定制化的定位分数。将该方法应用于筛选某些激酶抑制剂的先导片段及类似物时，不仅解析了已知的药物结合位点，还发现了能够影响RTN4和COX5A蛋白活性的新型小分子结合位点。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1038/s41557-026-02127-4