本报讯(记者彭科峰)中科院动物所李明研究组与北京诺禾致源生物信息科技有限公司等单位合作,利用二代Illumina HiSeq2000测序平台,对金丝猴属4个物种(川金丝猴、滇金丝猴、黔金丝猴和缅甸金丝猴)的38个个体进行了全基因组重测序和群体基因组学分析,揭示了这一濒危灵长类动物的遗传多样性、演化历史及其与环境的关系,以及对高海拔环境的遗传适应机制。相关成果发布于《分子生物学与进化》。
研究结果显示金丝猴的遗传多样性低于其他灵长类物种,而接近于一些濒危食肉类。系统发育重建和遗传结构分析显示,川金丝猴主要有两个遗传簇(分别由神农架种群和秦岭—岷山—邛崃等山系种群组成),暗示其应作为独立遗传管理单元。
另外,秦岭种群与岷山—邛崃等种群间有较强的基因交流。PSMC模型也显示不同山系类群之间有效种群大小波动趋势不尽相同。
而结合古气候数据的SDM模型模拟则表明金丝猴的分布区变迁与气候之间存在紧密关系。研究同时还检测了金丝猴属不同物种之间的遗传负荷和滇金丝猴对高海拔环境适应性相关的新候选基因。
该项研究首次从基因组和群体层面揭示了金丝猴属的遗传多样性、演化历史与环境的关系、遗传负荷以及金丝猴对极端环境的适应性进化。
《中国科学报》 (2016-09-01 第4版 综合)