作者:文乐乐 来源:中国科学报 发布时间:2022/1/23 22:07:09
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今年底要测序3000个基因组
地球生物基因组计划雄心勃勃

 

1月17日,美国《国家科学院院刊》刊发了一组文章,描述了地球生物基因组计划(EBP)的目标、迄今的成就和下一步的行动。这意味着旨在绘制地球上所有植物、动物、真菌和其他微生物基因组图的EBP进入一个新阶段,从试点项目转向全面测序。

“EBP特辑报道了生物学史上最大规模协同工作的本质和激动人心之处。”EBP工作组主席、美国加利福尼亚大学戴维斯分校进化与生态学教授Harris Lewin说,“从基础科学,到在一系列广泛紧迫的全球问题上的突破性应用——例如,防止生物多样性丧失、使粮食作物适应气候变化,EBP在真核生物测序方面的进展鼓舞人心。现在,我们似乎可以实现对所有真核生物进行测序的最终目标。”

EBP于2018年11月启动,其目标是提供所有180万种已命名植物、动物、真菌以及单细胞真核生物的完整DNA序列目录。建立所有已知真核生物的DNA序列数字库有助于创造有效工具,来防止生物多样性丧失和病原体传播,监测保护生态系统,并加强生态系统服务。

该项目作为一个国际网络发挥作用,协同许多工作,例如,加利福尼亚保护基因组项目、达尔文生命树项目、脊椎动物基因组项目等。

2018至2020年是EBP的启动阶段。到2023年,EBP第一阶段的目标是产生代表约9400个分类科的参考基因组。迄今已产生大约200个这样的参考基因组,预计到2022年底将完成3000多个基因组的测序、组装和注释,约占第一阶段目标的1/3。

截至2021年12月,该项目涉及除南极洲以外各大洲22个国家44个成员机构的5000名科学家和技术人员。目前49个附属项目涵盖了主要的真核生物群体,获得了数以万计的高质量样本。

相关论文信息:https://doi.org/10.1073/pnas.2115635118

 
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