《国家科学院院刊》

一种玻璃动力学弛豫起源于双尺度能量景貌

日本东京大学Atsushi Ikeda课题组发现玻璃动力学中的Johari-Goldstein β弛豫起源于双尺度能量景貌。相关研究成果3月29日发表于美国《国家科学院院刊》。

过去的实验广泛观察到在低温下松弛动力学分为两个不同的过程，而许多种分子液体都出现了这种现象。其中一个可能的解释是这种分离源于势能景貌的两级分层地形，但尚未得到证实。为解决这个问题，分子动力学模拟是一种有前途的方法。然而这要克服两个困难，首先，必须处理一个计算量大的分子液体模型，这与已经广泛研究但只显示出较慢过程（α松弛）的简单球形模型相比，需要更高的计算资源。其次，必须达到足够低的温度区间，使得两个过程能够明显分离。

该课题组处理了一个表现出较快过程（Johari-Goldstein β松弛）的非对称二聚体系统，并采用平行淬火法来访问低温区间。这使他们能够详细研究势能景貌并揭示诱导β松弛地形层次结构的第一手直接证据。此外，他们还成功表征了每个松弛过程中颗粒的微观运动。最后，他们研究了低频模式与两个松弛过程之间的相关性。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1073/pnas.2215153120

《自然-遗传学》

泛癌分析确定源自可转座元件的肿瘤特异性抗原

美国圣路易斯华盛顿大学Ting Wang研究团队发现，泛癌分析确定源自可转座元件（TE）的肿瘤特异性抗原。相关成果3月27日发表于《自然-遗传学》。

TE内的隐蔽启动子在肿瘤中可被转录重新激活，产生新的TE-嵌合转录物，从而导致免疫原性抗原。

研究人员在33个TCGA肿瘤类型、30个GTEx成人组织和675个癌症细胞系中，对这些TE外显事件进行了全面筛选，并确定了1068个TE候选者，它们有可能产生共享的肿瘤特异性TE嵌合抗原（TS-TEA）。全细胞裂解物和HLA-pulldown质谱数据证实，TS-TEA呈现在癌细胞表面。此外，研究人员强调了由TE启动子转录的肿瘤特异性膜蛋白，它们构成了癌细胞外表面的异常表位。总的来说，研究人员展示了TS-TEA和非典型膜蛋白在泛癌中的高流行率，这些膜蛋白有可能被治疗性地利用和靶向。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1038/s41588-023-01349-3

胎儿早期发育产生神经母细胞瘤

德国癌症研究中心Thomas Hofer等研究人员合作发现，神经母细胞瘤在胎儿早期发育中产生并且演化时间可预测结果。相关论文3月27日发表于《自然-遗传学》。

神经母细胞瘤是婴儿中最常见的实体瘤，并显示出非常不同的结果，从自发的消退到致命的疾病。这些不同的肿瘤起源于何时？它们是如何演变的？目前尚不清楚。

研究人员通过深入分析全基因组测序、分子钟分析和涵盖所有亚型的综合队列的群体遗传模型，量化了神经母细胞瘤的体细胞演化。研究人员发现，整个临床谱系中的肿瘤早在怀孕前3个月就开始通过异常有丝分裂发展。预后良好的神经母细胞瘤在短暂演化后克隆性地扩展，而侵袭性神经母细胞瘤则显示出长时间的演化，在这期间它们获得端粒维持机制。最初的非整倍体化事件制约了随后的演化，而侵袭性神经母细胞瘤表现出早期的基因组不稳定性。研究人员在发现队列（n=100）中找到，并在一个独立队列（n=86）中验证，演化的持续时间是一个准确的预测结果。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1038/s41588-023-01332-y