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浙江大学医学院附属第二医院 |
循环细菌DNA有望成为结直肠癌早期诊断标志物 |
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本报讯(记者崔雪芹)近日,浙江大学医学院附属第二医院大肠外科教授丁克峰团队在《癌症通讯》上发表研究论文,报道了结直肠癌患者与健康人群之间循环细菌DNA的差异性改变,探索了循环细菌DNA作为结直肠癌早期诊断新型生物标志物的潜力。
探索可用于结直肠癌早期诊断的新型生物标志物是目前的研究热点。近年来,研究者发现在循环游离DNA(cfDNA)中可检出细菌等微生物DNA。然而,结直肠癌患者的循环细菌DNA是否存在特异性改变,及其能否作为结直肠癌早期诊断的新型生物标志物仍有待探索。
在这项概念验证性研究中,研究人员纳入了病理确诊的早期结直肠癌患者、病理确诊的结直肠腺瘤患者和肠镜筛查阴性的健康人,提取血浆cfDNA并进行全基因组测序。根据循环细菌DNA的相对丰度,科研团队鉴定得到127个在结直肠癌患者与健康人之间显著差异的循环细菌DNA。
以结直肠癌患者和年龄、性别匹配的健康人作为发现集,基于上述127个差异细菌使用随机森林递归特征消除法,研究人员构建获得了由28个循环细菌DNA组成的结直肠癌早期诊断模型。研究发现,基于这28个循环细菌DNA的相对丰度进行主成分分析,可以发现结直肠癌患者与结直肠腺瘤患者有较大重叠,而与健康人几乎不存在重叠。进一步分析发现,结直肠腺瘤患者的28个循环细菌DNA相对丰度介于健康人和结直肠癌患者之间,并且大多数循环细菌DNA相对丰度更接近结直肠癌患者。
这项研究是首个尝试表征结直肠癌患者血液cfDNA中细菌DNA特征的研究,其结果发现了结直肠癌患者和健康人之间cfDNA细菌DNA组成的显著差异,为发掘结直肠癌及腺瘤的非侵入性诊断方式开启了一扇新的大门。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1016/j.canlet.2020.11.030
《中国科学报》 (2020-12-09 第4版 综合)