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西安电子科技大学 |
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最优控制节点算法提供癌症新靶标组合 |
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本报讯（记者张行勇） 近日，西安电子科技大学计算机科学与技术学院博士生胡宇轩、教授高琳和宾夕法尼亚大学教授Tan Kai开发出了最优控制节点算法，该算法可为疾病联合治疗提供新的候选靶标组合。相关成果日前发表于《自然—通讯》。
为防止癌症复发，在手术切除实体肿瘤后，化疗、靶向治疗、免疫治疗以及这些疗法的联合通常被作为后续治疗方案。目前大多数联合治疗的开发侧重于确定现有药物的协同组合，但现有药物仅靶向蛋白质组的很小一部分。大量基因及其组合仍未作为潜在的联合治疗靶标进行探索。
研究人员通过使用基因表达作为网络可控性框架中的约束，开发了最优控制节点（OptiCon）算法，这是一个基于网络可控性理论，从基因网络中识别协同调控因子的创新性算法。该算法不需使用药物等先验信息，通过对网络模型上的组合优化问题求解，为疾病联合治疗提供新颖的候选靶标组合。研究人员不仅在计算层面对OptiCon预测结果进行了评估，还使用CRISPR/Cas9基因编辑技术验证了结果准确性。
相关论文信息：http://doi.org/10.1038/s41467-019-10215-y
《中国科学报》 (2019-07-08 第4版 综合)
