期刊名：Genes

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Genes期刊2024-2025高引文章荐读，为您提供最受欢迎的研究进展！

MicroRNA (miRNA) 是一类长约18-25个核苷酸的非编码小分子RNA，通过调控基因表达参与细胞增殖、分化、凋亡等多种关键生物学过程。miRNA表达异常与肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、糖尿病等多种人类疾病密切相关。在临床应用方面，循环miRNA可作为疾病诊断、分型和预后判断的非侵入性生物标志物，同时miRNA模拟物和抗miRNA寡核苷酸也展现出作为新型治疗药物的潜力，目前已有多个基于miRNA的候选药物进入临床试验阶段。凭借其组织特异性、稳定性和调控网络的核心地位，miRNA已成为精准医疗领域的重要研究方向。

1. Gene Variants in Components of the microRNA Processing Pathway in Chronic Myeloid Leukemia

慢性粒细胞白血病中microRNA加工通路组分的基因变异

文章链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/15/8/1054

文章介绍：目前慢性粒细胞白血病 (CML) 的治疗已显著改善了患者的预期寿命，使其接近健康人群的水平。然而，除 BCR::ABL1 融合基因外，CML 中其他分子改变仍知之甚少。miRNA 是基因表达的重要调控因子，miRNA 生物合成通路中某些组分的变异与多种癌症的遗传易感性相关。因此，本研究旨在评估参与 miRNA生物合成的基因变异与 CML 易感性的关联。我们使用 TaqMan 探针，对 296 例 CML 患者和 485 例健康对照者中 8 个参与 miRNA 生物合成的基因的 15 个变异位点进行了基因分型。采用卡方检验评估基因变异与 CML 及临床变量的关联，并使用逻辑回归估计比值比 (OR) 和 95% 置信区间 (CI)。结果显示，DICER1 基因中的 rs13078 变异在 CML 患者中的发生率显著高于健康对照者。此外，根据Hasford评分，rs7813和rs2740349变异体与较差的预后显著相关，而rs2740349变异体还与较晚的诊断年龄相关。这些发现提示，miRNA生物合成通路组分的变异可能与慢性粒细胞白血病（CML）的遗传风险有关。

2. Evaluating the Urinary Exosome microRNA Profile of von Hippel Lindau Syndrome Patients with Clear Cell Renal Cell Carcinoma

透明细胞肾细胞癌合并 von Hippel Lindau 综合征患者尿液外泌体 microRNA 表达谱的评估

文章链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/15/7/905

文章介绍：肾细胞癌是全球十大常见恶性肿瘤之一，发病率和死亡率均较高。肾癌通常在晚期才被发现，几乎总是致命的。尽管人们在寻找治疗的分子靶点方面取得了长足的进步，希望能够提高患者的生存率，但我们仍然缺乏早期检测或疾病进展的有效标志物。冯·希佩尔-林道综合征（VHL）是一种常染色体显性遗传的癌症遗传综合征，患者有罹患双侧和多灶性肾细胞癌（RCC）以及其他肿瘤的风险。这些患者为研究尿液外泌体miRNA生物标志物在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）早期发展中的应用潜力提供了一个理想的平台，因为这些患者会定期接受影像学检查，并在肿瘤达到3厘米之前进行积极监测，之后才会考虑手术切除。这使得术前和术后尿液样本的收集以及与切除肿瘤组织的比较成为可能。研究尿液中不同的生物标志物可以为患者和医生提供全面的分子谱分析，并可作为肿瘤遗传信息的重要来源。从接受监测和透明细胞肾细胞癌手术切除的VHL患者队列中获取术前和术后尿液样本，并提取外泌体。对从尿液来源的外泌体和切除的ccRCC的FFPE材料中提取的miRNA进行miRNA-Seq分析。miRNA-Seq分析显示，VHL患者和正常对照组的尿液外泌体来源的miRNA表达谱存在显著差异。这包括miR-320家族（例如miR-320a）表达的降低，已知miR-320a在散发性ccRCC中表达降低，并受到VHL基因缺失激活的HIF1α转录因子的抑制。 miR-542-5p 是 VHL 相关透明细胞肾细胞癌的潜在标志物，在正常对照组尿液外泌体中表达较低，在 VHL 肿瘤患者术前尿液外泌体中显著升高，并在肿瘤切除后恢复至正常水平。与此相符的是，与正常肾脏相比，VHL 相关 ccRCC 中 miR-542-5p 的表达也升高。本研究表明，利用易于获取的生物体液进行外泌体 miRNA 分析，既可以区分 VHL 患者尿液中的 miRNA 和正常对照组尿液中的 miRNA，也可以为 VHL 综合征相关 ccRCC 的诊断提供生物标志物。需要进一步的验证性研究来证实尿液外泌体来源的 miRNA 作为肾癌生物标志物的实用性。

3. The Involvement of the microRNAs miR-466c and miR-340 in the Palmitate-Mediated Dysregulation of Gonadotropin-Releasing Hormone Gene Expression

miR-466c 与 miR-340 在棕榈酸介导的促性腺激素释放激素基因表达失调中的作用

文章链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/15/4/397

文章介绍：高饱和脂肪酸饮食与肥胖和不孕症相关。棕榈酸是循环中最常见的饱和脂肪酸，可被下丘脑神经元感知，从而导致体内平衡失调。值得注意的是，棕榈酸可提高促性腺激素释放激素 (Gnrh) mRNA 及其激活转录因子 GATA 结合蛋白 4 (Gata4) 的 mRNA 水平。GATA4 通过结合Gnrh增强子区域对其基础表达至关重要，而 Oct-1 (Oct1) 和 CEBP-β (Cebpb) 则发挥调控作用。目前尚未研究棕榈酸对 Gnrh 的转录前和转录后调控机制。鉴于棕榈酸能够改变 miRNA 的表达，我们假设棕榈酸介导的 Gnrh mRNA 表达失调涉及特定的 miRNA。在 mHypoA-GnRH/GFP 神经元中，棕榈酸酯显著下调了六种 miRNA（miR-125a、miR-181b、miR-340、miR-351、miR-466c 和 miR-503）的表达，而 100 μM 油酸酯的联合处理则减弱了这种抑制作用。后续的模拟转染实验表明，miR-466c 显著下调了Gnrh、Gata4和Chop mRNA 的表达，并上调了Per2的表达；而 miR-340 则上调了Gnrh、Gata4、Oct1、Cebpb和Per2 mRNA 的表达。我们的研究结果表明，棕榈酸酯可能通过改变 miR-466c 和 miR-340 的表达，进而调控转录因子的表达水平，从而在转录前和转录后水平间接调控Gnrh的表达。总之，棕榈酸酯介导的Gnrh失调以及由此导致的生殖功能障碍涉及平行的转录机制。

4. Cyto-Histological Profile of MicroRNAs as Diagnostic Biomarkers in Differentiated Thyroid Carcinomas

分化型甲状腺癌中microRNA作为诊断生物标志物的细胞组织学特征

文章链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/15/3/389

文章介绍：甲状腺癌中miRNA的谱系正逐渐被阐明。在分化型甲状腺癌（DTC）中，乳头状甲状腺癌（PTC）最为常见。评估miRNA的表达有助于改进术前诊断，从而为患者提供个体化且更有效的治疗。本研究旨在评估（1）一系列DTC中的miRNA及其与特定基因突变的关联，以期改进DTC/PTC的诊断并预测其生物学行为。（2）评估超声引导下细针穿刺细胞学检查（US-FNAC）中分子检测的可靠性，以实现更精确的术前诊断。本系列研究纳入106例接受手术治疗的患者，共176份样本（98份细胞学样本和78份组织学样本），其中包括13例良性病变（对照组）和93例分化型甲状腺癌（病例组）。采用定量逆转录-聚合酶链式反应（qRT-PCR）检测miR-146b、miR-221、miR-222和miR-15a的表达水平。结果采用2−ΔΔCT法进行分析，以miR-16作为内参。在乳头状甲状腺癌（PTC）的诊断中，采用受试者工作特征曲线下面积（AUC）评估miRNA表达的鉴别能力。在PTC中，评估了miRNA表达与临床病理特征以及基因突变（BRAF、RAS和TERTp）之间的关联。与良性病变相比，所有分析的miRNA在分化型甲状腺癌（DTC）/乳头状甲状腺癌（PTC）中均表现出过表达趋势，无论是在细胞学还是组织学样本中。在细胞学中，恶性肿瘤中miRNA的表达水平高于良性肿瘤。在组织学样本中，各 miRNA 对乳头状甲状腺癌（PTC）诊断的鉴别能力如下：miR-146b（AUC 0.94，95% CI 0.87–1）、miR-221（AUC 0.79，95% CI 0.68–0.9）、miR-222（AUC 0.76，95% CI 0.63–0.89）、miR-15a（AUC 0.85，95% CI 0.74–0.97）。miR-146b 的敏感性（se）为 89%，特异性（sp）为 87%；miR-221 se = 68.4，sp = 90；miR-222 se = 73，sp = 70；miR-15a se = 72，sp = 80。miRNA 与乳头状甲状腺癌 (PTC) 的不良预后临床病理特征相关 (p < 0.05)，尤其是 miR-222。我们的数据表明，在 BRAF 突变存在的情况下，miR-146b、miR-221 和 miR-222 的高表达水平显著升高 (p < 0.001)；此外，miR-146b (p = 0.016) 和 miR-221 (p = 0.010) 的高表达水平与 RAS 突变存在显著相关性，提示这些突变与 miRNA 的表达存在相互作用。尽管本研究样本量相对较小，但细胞学中 miRNA 的过表达可能有助于更精确的术前诊断。 miRNA在PTC诊断中展现出良好的鉴别能力。miRNA表达谱与基因改变之间的关联性有助于FNAC中DTC/PTC的准确诊断。

5. Myelin-Specific microRNA-23a/b Cluster Deletion Inhibits Myelination in the Central Nervous System during Postnatal Growth and Aging

髓鞘特异性microRNA-23a/b簇缺失抑制出生后生长和衰老过程中中枢神经系统的髓鞘形成

文章链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/15/4/402

文章介绍： 包含 miR-23a/b 簇的miRNAs，尤其是 miR-23a 和 miR-27a，因其在中枢神经系统髓鞘形成中的多样作用而被熟知。然而，簇特异性 miRNA 的功能仍存在争议，有研究表明同一簇内的 miRNAs 可能发挥互补作用。本研究旨在利用 miR-23a/b 簇敲除小鼠（KO 小鼠），明确 miR-23a/b 簇在髓鞘形成中的作用，具体聚焦于表达髓鞘蛋白脂质蛋白（PLP）的髓鞘。通过将 miR-23a/b cluster^flox/flox小鼠与PlpCre-ERT2 小鼠杂交，构建可诱导的条件性 KO 小鼠；在子代小鼠出生后 10 天或 10 周龄时注射他莫昔芬，以诱导髓鞘特异性 miR-23a/b 簇缺失。在小鼠 10 周龄或 12 月龄时进行评估，并与未接受他莫昔芬处理的对照小鼠进行比较。KO 小鼠在 10 周龄和 12 月龄时均表现出运动功能受损，以及脑和脊髓中髓鞘鞘发育不良。同时，KO 小鼠中髓鞘碱性蛋白（MBP）和PLP的表达显著降低。少突胶质前体细胞和成熟少突胶质细胞的比例在 KO 小鼠与对照小鼠之间无显著差异，但表达MBP的少突胶质细胞比例在 KO 小鼠中显著降低。此外，KO 小鼠的蛋白表达发生改变：亮氨酸拉链样转录调节因子 1（Lys1）表达升高，R-RAS 表达降低，细胞外信号调节激酶的磷酸化水平下降。这些发现强调了 miR-23a/b 簇在出生后生长和衰老过程中对髓鞘形成的重要影响。

6. Methods for Extracellular Vesicle Isolation: Relevance for Encapsulated miRNAs in Disease Diagnosis and Treatment

细胞外囊泡分离方法：及其在疾病诊断与治疗中对内含miRNA的意义

文章链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/16/3/330

文章介绍：细胞外囊泡（EVs）是一类纳米级囊泡，在生理和病理条件下，它们通过携带包括miRNAs在内的关键生物分子，促进细胞间的通讯。这些囊泡广泛存在于血液、尿液和唾液等多种体液中，且其含量随疾病进展而波动，使其成为极具价值的诊断工具。然而，由于EVs体积微小且生物学特性复杂，对其进行分离极具挑战性。本文总结了目前最常用的EVs分离方法的原理，包括超速离心、沉淀法、免疫亲和法、分选法、超滤法、体积排阻色谱法以及微流控技术，并重点阐述了各类方法的优缺点。此外，我们还综述了用于鉴定和定量循环miRNAs的主要策略，并特别关注了那些被EVs包裹的miRNAs。鉴于这些miRNAs凭借其卓越的稳定性和潜在的治疗价值而备受临床关注，本文所提供的信息将为未来基于EVs包裹miRNAs的疾病诊断与治疗研究提供有益的指导，助力这一充满前景的领域向前发展。

7. MicroRNAs miR-148a-3p, miR-425-3p, and miR-20a-5p in Patients with IgA Nephropathy

IgA肾病患者中的MicroRNA miR-148a-3p、miR-425-3p和miR-20a-5p

文章链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/16/2/125

文章介绍： IgA肾病（IgAN）是导致肾衰竭的最常见的肾小球肾炎类型之一。研究已证实，miRNAs在IgA肾病的发病机制及临床病程中发挥着重要作用；因此，它们为该病的无创诊断提供了可能性，且在预测疾病预后方面具有一定的价值。本研究旨在评估IgA肾病患者血浆中miR-148a-3p、miR-425-3p和miR-20a-5p的水平，并探讨其与特定临床指标的相关性。方法：本研究共纳入44例IgA肾病患者及46名对照组受试者。研究结果显示，在IgA肾病患者中，血浆miR-148a-3p和miR-425-3p水平的升高与估算肾小球滤过率（eGFR）呈负相关。依据Haas分级标准，与组织病理学改变分级为第1、2期的患者相比，分级为第3、4、5期的患者其血浆miR-20a-5p水平呈统计学显著升高。本研究结果提示，miR-148a-3p、miR-425-3p和miR-20a-5p可能参与了IgA肾病的发病过程。

8. Altered miRNA Signatures in Follicular Fluid: Insights into Infertility Etiologies

卵泡液中改变的miRNA表达谱：不孕病因学研究新视角

文章链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/16/5/537

文章介绍：不孕症是一种生殖系统疾病，全球约 10%–15% 的育龄夫妇受其困扰。近年研究提示，卵泡液中miRNA或可为评估生殖潜能与卵泡健康状态提供依据。本研究结合不孕病因，对接受体外受精（IVF）患者卵泡液中 miRNA 表达谱的改变进行分析。研究人群中明确了四种主要不孕病因：多囊卵巢综合征（PCOS）、盆腔炎性疾病（PID）、男性因素不孕及不明原因不孕（UI）。本研究旨在探讨上述各类不孕诊断是否与特征性卵泡生理状态相关，并筛选与各类病症相关的异常 miRNA 表达模式。采用 Ingenuity Pathway Analysis（IPA）解析异常 miRNA 表达谱对关键生物学过程的调控作用。基因芯片数据的生物信息学分析显示，各研究亚组卵泡液（FF）中均存在特征性异常 miRNA 表达模式。与健康对照组相比，PCOS 组检出 25 个差异表达 miRNA（9 个下调、16 个上调），PID 组检出 21 个（15 个下调、6 个上调），UI 组检出 34 个（24 个下调、10 个上调）。上述异常 miRNA 表达谱参与调控多条关键信号通路，包括激素调控与组织重塑等生物学过程，呈现复杂的交互作用。本研究筛选出各组间存在显著差异表达的关键 miRNA，提示其具备作为生物标志物的潜力，可用于提升诊断精准度并指导靶向治疗策略。上述结果为阐明生殖系统疾病的分子机制提供了重要参考，同时也表明有必要开展进一步研究以开发靶向干预手段，进而改善患者诊疗结局。

9. The Emerging Role of MicroRNAs in Nasal Inflammatory Diseases and Tumors: From Bench to Bedside

MicroRNA在鼻部炎症性疾病与肿瘤中的新兴作用：从基础研究到临床应用

文章链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/16/3/295

文章介绍：miRNAs在调节免疫应答中发挥着至关重要的作用，并被证实与多种鼻部疾病（包括慢性鼻窦鼻腔炎 (CRS)、变应性鼻炎 (AR) 和鼻腔鼻窦肿瘤）的发病机制密切相关。本综述全面探讨了miRNAs在鼻部炎症性及肿瘤性疾病中日益凸显的作用，并重点阐述了其在诊断、预后判断及治疗方面的潜在应用价值。方法：本研究通过对现有文献进行全面回顾，归纳总结了关于miRNAs在鼻部炎症性疾病及肿瘤中表达情况的最新研究成果。重点分析了评估miRNA介导的调控机制、潜在生物标志物应用价值以及相关治疗策略的关键性研究。结果：miRNAs表达谱的异常改变参与了CRS、AR及鼻腔鼻窦肿瘤的发病过程。特定的miRNAs（如miR-125b和miR-155）在CRS和AR患者体内呈上调趋势，进而促进炎症反应及组织重塑。而在鼻腔鼻窦肿瘤中，表达失调的miRNAs（包括miR-126以及miR-34/miR-449簇）则会影响肿瘤的进展及对治疗的应答效果。基于外泌体介导的miRNA递送技术正作为一种极具前景的精准医疗手段崭露头角，为开发基于miRNA的诊断及治疗新策略提供了全新的思路。结论：miRNAs作为鼻部疾病的关键调控因子，在非侵入性诊断及靶向治疗领域展现出巨大的应用潜力。深入开展针对miRNA相关干预手段的研究，有望进一步改善治疗预后，并推动鼻部炎症性疾病及恶性肿瘤领域个性化医疗方案的开发与应用。

10. MicroRNAs as Potential Biomarkers for Alzheimer’s Disease in Women

MicroRNA 作为女性阿尔茨海默病的潜在生物标志物

文章链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/16/8/943

文章介绍：阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease, AD）在全球范围内影响约 5000 万人，其中女性占患者总数的三分之二。尽管这种性别差异影响显著，但女性 AD 背后的性别特异性病理机制仍知之甚少，且针对女性的特异性生物标志物研究严重不足。这一关键知识缺口需要针对性研究，以改进女性 AD 患者的诊断与治疗方案。本综述系统梳理了女性 AD 的潜在病理机制，包括炎症、自噬及代谢功能障碍方面的性别差异；进一步探讨了miRNA表达模式，并基于现有文献评估 miRNA 作为女性 AD 潜在生物标志物的可行性。通过分析，我们从多项独立研究中鉴定出约 20 个 miRNA 候选标志物，这些标志物来源于人脑组织、血液及脑脊液等多种人类样本，展现出开发易获取、无创生物标志物的潜力，尤其是在血液和脑脊液中发现的标志物。然而，不同研究间的重叠度较低，表明女性 AD 特异性 miRNA 生物标志物研究仍处于早期发现阶段，亟需开展大规模验证研究与标准化方法学，以推动该领域向临床应用转化。

Genes期刊介绍

主编：Selvarangan Ponnazhagan, The University of Alabama at Birmingham, USA

期刊主题涵盖了与DNA、RNA、染色体、基因、遗传学和多组学相关的所有内容。下设18个专题，从人类、动物、植物、微生物、分子遗传、种群进化和高新技术等多个角度全方位审视遗传学和基因组学的前沿研究。