期刊名称：Biomolecules

期刊链接：https://www.mdpi.com/journal/biomolecules

本期编辑荐读精选了Biomolecules期刊2024年第一期至第十二期的封面文章，内容涵盖Piezo1调控、癌症转移、双吲哚衍生物、阿尔茨海默病、抗菌肽合成、神经生长因子等多方面主题。Biomolecules编辑部希望与读者分享相关领域最新的研究进展，为相关领域的研究学者提供新的思路和参考，欢迎阅读。

Volumn 15 Issue 1

Extracellular Vesicles and Tunnelling Nanotubes as Mediators of Prostate Cancer Intercellular Communication

细胞外囊泡和隧道纳米管作为前列腺癌细胞间通讯的介质

Jessica K. Heatlie, et al

https://doi.org/10.3390/biom15010023

文章亮点:

1. 利用活细胞成像显微镜，我们观察到 PCa 细胞、非恶性细胞和免疫细胞之间存在广泛的 TNT 和 EV 相互作用。PCa 细胞能够转移溶酶体、线粒体、脂质和内质网，以及 syndecan-1、sortilin、Glut1 和 Glut4。

2. 在机制研究中，我们发现雄激素敏感的 PCa 细胞在 R1881 处理后会发生细胞形态的改变。。

3. PCa 的 TNT 和 EV 运输蛋白质和细胞器，这些物质可能包含支持癌症生长和进展的特殊信号传导、程序化和能量需求。

Volumn 15, Issue 2

Ubiquitin-Specific Protease Inhibitors for Cancer Therapy: Recent Advances and Future Prospects

泛素特异性蛋白酶抑制剂在癌症治疗中的应用：最新进展与未来展望

Mohamad Bakkar, et al

https://doi.org/10.3390/biom15020240

文章亮点:

(1) 本文综述了以下内容：USP的结构和功能特征，重点阐述其在关键癌症相关通路中的作用；USP抑制剂的发现、化学结构、作用机制及其在癌症治疗中的潜在临床应用。

(2) 本文特别关注USP抑制剂在增强癌症免疫治疗中的作用，例如调节肿瘤微环境、影响调节性T细胞功能以及影响免疫检查点通路。

(3) 本文总结了目前USP抑制剂作为癌症治疗药物的临床试验进展和挑战。还探讨了实现靶向选择性的复杂性、开发更具特异性和高效性的USP抑制剂的持续努力，以及USP抑制剂克服耐药性和与现有癌症疗法协同作用的潜力。

Volumn 15, Issue 3

THOP1 Is Entailed in a Genetic Fingerprint Associated with Late-Onset Alzheimer’s Disease

THOP1参与了与晚发性阿尔茨海默病相关的遗传特征

Sharlee Climer

https://doi.org/10.3390/biom15030337

文章亮点:

(1) 本文提出的模式为阿尔茨海默病（AD）的病理生理学提供了新的见解，因为它揭示了一种高维遗传变异，包含23个不同的单核苷酸多态性（SNP）等位基因，这些等位基因与这种神秘疾病密切相关。

(2) 未来利用CRISPR技术和/或动物模型，以及对受影响的下游产物（包括RNA和蛋白质）进行定量分析，有望揭示这种特定遗传特征与AD之间的潜在机制和因果关系。

(3) 更广泛地说，本文展示了一种系统性地揭示与复杂表型相关的高维遗传模式的研究策略。

Volumn 15, Issue 4

How Does the Archaellum Work?

Archaellum是如何运作的？

Morgan Beeby, et al

https://doi.org/10.3390/biom15040465

(1) 作为细菌鞭毛的类似物，古菌鞭毛是存在于古菌中的长螺旋状尾部，由嵌入细胞包膜的旋转马达驱动旋转，从而产生推力以驱动细胞运动。

(2) 本文描述了古菌鞭毛功能的四个关键方面：组装、从组装到旋转的转变、旋转的机制以及旋转如何产生推力。

(3) 我们概述了未来有助于加深我们对古菌鞭毛功能理解的研究方向。

Volumn 15, Issue 5

Field-Effect Transistor Based on Nanocrystalline Graphite for DNA Immobilization

基于纳米晶石墨的场效应晶体管用于DNA固定化

Bianca Adiaconita, et al

https://doi.org/10.3390/biom15050619

(1) 本研究利用具有纳米晶石墨（NCG）沟道的FET来检测DNA核碱基。

(2) NCG优异的电子特性及其高比表面积使其能够与DNA核碱基形成强烈的π-π堆积相互作用，从而促进生物分子的高效吸附和稳定。核碱基直接吸附到NCG沟道上会导致器件电学特性发生显著变化，这些变化可以实时测量，用于评估DNA结合和序列识别。

(3) 该方法实现了高灵敏度、无标记的DNA检测，为快速基因分析和诊断开辟了新的可能性。

Volumn 15, Issue 6

MTPrompt-PTM: A Multi-Task Method for Post-Translational Modification Prediction Using Prompt Tuning on a Structure-Aware Protein Language Model

MTPrompt-PTM：一种基于结构感知蛋白质语言模型，利用提示调优进行翻译后修饰预测的多任务方法

Ye Han, et al

https://doi.org/10.3390/biom15060843

(1) 我们提出了 MTPrompt-PTM，这是一个多任务 PTM 预测框架，它通过将提示调优应用于结构感知蛋白质语言模型 (S-PLM) 而开发。

(2) MTPrompt-PTM 并非训练多个单任务模型，而是训练一个多任务模型，利用共享的特征提取层和任务特定的分类头来预测多种类型的 PTM 位点。

(3) 实验结果表明，MTPrompt-PTM 在 13 种 PTM 位点上的预测性能优于目前最先进的 PTM 预测工具，凸显了多任务学习和结构集成的优势。

Volumn 15, Issue 7

Insights into Membrane Damage by α-Helical and β-Sheet Peptides

α-螺旋和β-折叠肽对膜损伤的深入研究

Warin Rangubpit, et al

https://doi.org/10.3390/biom15070973

(1) 本文结合全原子分子动力学模拟和生物物理实验，研究了四种两亲性肽与脂质双层的相互作用。

(2) 我们的比较分析揭示了极性和非极性残基的细微重排如何调节肽诱导的水渗透。

(3)这为淀粉样蛋白病理学和抗菌肽设计提供了相关的机制见解。

Volumn 15, Issue 8

Increased Concentration of Anti-Egg Albumin Antibodies in Cerebrospinal Fluid and Serum of Patients with Alzheimer’s Disease—Discussion on Human Serpins’ Similarity and Probable Involvement in the Disease Mechanism

阿尔茨海默病患者脑脊液和血清中抗卵清蛋白抗体浓度升高——探讨人类丝氨酸蛋白酶抑制剂的相似性及其在疾病机制中的可能作用

Dionysia Amanatidou, et al

https://doi.org/10.3390/biom15081085

(1) 本研究采用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测了患者脑脊液（CSF）和血清中针对卵清蛋白、牛酪蛋白和N-羟乙酰神经氨酸（Neu5Gc）的抗体。

(2) 本研究表明，相当一部分阿尔茨海默病（AD）患者的血清和脑脊液中识别卵清蛋白的抗体水平升高，这表明针对卵清蛋白的免疫反应与阿尔茨海默病相关。

(3) 结果显示，AD患者血清中抗变性卵清蛋白抗体的水平随疾病严重程度的增加而升高，而抗天然卵清蛋白抗体在所有疾病阶段几乎恒定存在。

Volumn 15, Issue 9

Combined Radiations: Biological Effects of Mixed Exposures Across the Radiation Spectrum

联合辐射：混合辐射暴露对整个辐射谱的生物效应

Orfeas Parousis-Paraskevas, et al

https://doi.org/10.3390/biom15091282

(1) 本系统综述评估了其放射生物学效应和治疗应用，重点关注协同作用和潜在的生物学机制。

(2) 研究发现，协同效应和累加效应较为常见，且反应受剂量、顺序、辐射类型和DNA修复动力学的影响。联合治疗通常能提高疗效，而太空辐射研究揭示了多方面的生物损伤。

(3) 本综述为推进涉及联合辐射暴露的研究和应用提供了综合参考，强调了在治疗、辐射防护和太空飞行中深入了解机制和制定标准化方案的必要性。

Volumn 15, Issue 10

The Respiratory Burst of Human Granulocytes Is Mostly Independent of Potassium

人类粒细胞的呼吸爆发主要与钾无关

Iryna Mahorivska, et al

https://doi.org/10.3390/biom15101362

(1) 本研究探讨了细胞外钾离子浓度的变化是否会影响过氧化氢的产生。

(2) 结果表明，RB在多种离子条件下均能发挥作用，这些离子条件理论上可能由激素变化、大量坏死、脓毒症、血流停止等多种因素引起。

(3) 本文的另一项发现是RB具有内在的时间依赖性。这种时间依赖性在本文中得到了清晰的体现，但其机制尚无法解释。还需要进行更多实验来解开这个谜团。

Volumn 15, Issue 11

Local Insulin for Local Needs? Insights into Retinal Insulin Signaling and RPE Metabolism

局部胰岛素满足局部需求？视网膜胰岛素信号传导和RPE代谢的深入研究

Matilde Balbi, et al

https://doi.org/10.3390/biom15111570

(1) 视网膜内的胰岛素信号传导——包括系统性和局部产生的胰岛素——在维持血管和神经元完整性方面发挥着多重作用。

(2) 视网膜色素上皮（RPE）来源的胰岛素可能有助于一种内在的神经血管保护机制，它可能通过激活PI3K/Akt和MAPK/ERK通路来减轻氧化应激，调节葡萄糖和脂质代谢，并有助于抑制病理性血管生成。

(3) 识别并利用这种局部胰岛素来源，为开发创新性的、靶向代谢的疗法提供了有前景的途径，这些疗法可以补充现有疗法，并改善糖尿病视网膜疾病患者的预后。

Volumn 15, Issue 12

Targeting the Reactive Proteome: Recent Advances in Activity-Based Protein Profiling and Probe Design

靶向活性蛋白质组：基于活性的蛋白质谱分析和探针设计的最新进展

Yuan-Fei Zhou, et al

https://doi.org/10.3390/biom15121699

(1) 本文综述了活性位点蛋白质组学（ABPP）方法学的最新进展以及活性探针和光敏探针（PAL）的设计，并重点阐述了它们对未来化学生物学研究的意义。

(2) 通过持续的方法学创新，ABPP领域目前涵盖了多种定量和位点分辨平台，包括TOP-ABPP、IsoTOP-ABPP和竞争性IsoTOP-ABPP，这些平台共同实现了在蛋白质组尺度上对氨基酸反应性和小分子相互作用的精确评估。

(3) 化学和酶促可裂解连接子的引入，包括酸/碱、氧化还原、光照和蛋白酶触发的连接子，进一步完善了富集策略，提高了分析深度、重现性和下游蛋白质组学工作流程的正交性。