来源:Veterinary Sciences 发布时间:2025/6/20 15:07:21
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量子比特荧光分析揭示马驹血浆无细胞DNA基质效应及临床无关性 | MDPI Veterinary Sciences

论文标题:Investigation of Extracted Plasma Cell-Free DNA as a Biomarker in Foals with Sepsis

论文链接:https://doi.org/10.3390/vetsci11080346

期刊名:Veterinary Sciences

期刊主页:https://www.mdpi.com/journal/vetsci

研究背景

无细胞DNA (cfDNA) 是从细胞释放到各种体液中的碎片化细胞外DNA。先前发表的来自成年马的数据支持cfDNA作为潜在的疾病生物标志物,但也表明由于基质效应,直接测量血浆中的cfDNA是不准确的。目前尚不清楚马驹血浆中是否存在类似的基质效应。来自美国北卡罗来纳州罗利市北卡罗莱纳州立大学的M.Katie Sheats博士及其团队在Veterinary Sciences 期刊发表了文章,本研究的目的是利用量子比特荧光计研究马驹血浆中cfDNA荧光测量的潜在基质效应,并确定干净和/或提取的血浆cfDNA浓度在健康、生病的非感染性马驹 (SNS) 或感染性马驹中是否存在显著差异。

健康、脓毒症和患病 (非脓毒症) (SNS) 小马驹提取的cfDNA浓度比较。显著性设置为p < 0.05。ns = 不显著

研究过程

我们假设基质效应会干扰马驹血浆中cfDNA的精确荧光测量。此外,我们假设与健康或SNS马驹相比,败血症马驹血浆中提取cfDNA的平均浓度和/或提取cfDNA与中性粒细胞的比值会升高。在60匹马驹的纯血浆中测量无细胞DNA,然后用商业试剂盒提取DNA。马驹血浆同时表现出自身荧光和非特异性染料结合,证实了基质效应。然而,即使进行提取,健康马驹 (脓毒症评分≤5)、SNS马驹 (脓毒症评分6-11,血培养阴性) 或脓毒症马驹 (脓毒症评分≥12±血培养阳性) 之间的cfDNA浓度或cfDNA:中性粒细胞比例均无显著差异。

研究总结

在纯血浆中测量无细胞DNA,然后用商业试剂盒提取DNA,使用Qubit 4荧光仪和1×dsDNA HS检测试剂盒,从60匹马驹中提取DNA。我们的数据表明,基质效应干扰了马驹血浆中cfDNA的精确量子比特测量,并支持了先前的研究结果。我们的数据也支持先前的发现,即血浆cfDNA浓度与马驹败血症诊断无关。

对马驹血浆中量子位测量的cfDNA浓度的初步分析显示,稀释度线性度高,变异系数相对较低,与先前对人类、狗和马的报道一致。这些发现似乎支持荧光测量整洁马驹血浆中cfDNA浓度的准确性、精确性和稳定性。然而,进一步的研究表明,净血浆中cfDNA浓度与SNS和败血症马驹的提取样本之间的相关性较差,这表明在病马驹的净血浆样本中cfDNA测量缺乏准确性。鉴于此,进一步评估样品的非特异性染料结合和自身荧光。

这项研究的数据为继续研究马驹NETosis的病理学和马驹NETosis的临床标志物提供了支持,因为它们似乎与成年马和其他物种不同。目前尚不清楚这种差异是否有助于马驹常见疾病 (如肺炎或败血症) 的病理生理学。由于从败血症马驹中提取的血浆cfDNA浓度差异很大,未来的研究应该针对纵向cfDNA测量,以确定时间、败血症阶段或对治疗的反应对新生儿马驹cfDNA和NETosis的其他标志物的影响。

Veterinary Sciences 期刊介绍

主编:Patrick Butaye, Ghent University, Belgium; City University of Hong Kong, China

发表与兽医科学领域相关的原创研究文章、评论、通讯和简短说明,主题包括动物疾病、紊乱和损伤的预防、诊断和治疗。

2024 Impact Factor
2.3
2024 CiteScore
3.5
Time to First Decision
21.2 Days
Acceptance to Publication
2.7 Days

 

 
 
 
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