作者:赵广立 来源:中国科学报 发布时间:2021/11/5 22:18:40
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我国“超算抗疫”成果入围“戈登贝尔特别奖”

 

11月5日,记者从国家超级计算天津中心获悉,由该中心联合国防科技大学计算机学院、海南大学药学院、中山大学药学院、中国海洋大学医药学院、美国肯塔基大学药学院等单位,在天河新一代超级计算机上完成的“超算抗疫”工作,成功入围2021年度的戈登贝尔新冠特别奖。

这是我国首次入围该奖项。作为国际高性能计算应用领域的最高学术奖项,美国计算机协会(ACM)评选和颁发的戈登贝尔奖被称为“超算领域的诺贝尔奖”,具有较大国际影响力。为应对新冠疫情暴发,ACM于2020年首次设立“戈登贝尔奖新冠特别奖”,以表彰在“超算抗疫”方面取得的杰出研究成果。其评价的主要标准为“通过高性能计算的应用和创新,对理解疾病本质、控制疾病传播或发现有效治疗手段做出重要贡献”。2020年该奖项有6项成果入围,全部由美国包揽。

中国此次入围该奖项的成果名为基于“自由能微扰—绝对结合自由能方法的大规模新冠药物虚拟筛选”。研究人员通过利用天河新一代超级计算机的超大规模算力,使用国际领先的“药物-靶标结合精准评价计算方法”,实现了新冠应急药物(有效降低致死率和重症率)的快速筛选和发现。

 

超算抗疫示意图.jpg

基于FEP的药物发现新方法应用于抗新冠药物筛选示意图 国家超级计算天津中心供图

据国家超级计算天津中心介绍,该成果计算筛选得到的双嘧达莫药物已完成100多例的临床试验,其结果表明:双嘧达莫干预三周后,新冠重型患者临床症状明显改善,达到87.5%的出院率,明显优于对照组40%出院率;无死亡案例,无转成危重型案例,表明该药能提高治愈率并降低病亡率。该药与阿比多尔合用后,新冠普通型患者的出院率为100%,平均出院时间为7天,比单用阿比多尔提前了4天,显示出良好的治疗效果。

根据实际测算,在天河新一代超级计算机的支撑下,基于“自由能微扰—绝对结合自由能方法”的药物筛选效能提升了200倍。该项成果对于实现针对突发疫情的快速药物响应,具有极为重要的现实意义。同时,基于天河新一代超级计算平台,天津超算中心还联合了天津中医药大学张伯礼院士团队开展治疗新冠的中药有效成分筛选工作,开展中药现代化研究。

该成果由中国科学院院士、中科院上海药物研究所研究员陈凯先、北京航空航天大学教授钱德沛和荷兰阿姆斯特丹大学Hans Westerhoff教授提名推荐。

 
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