作者:Kanglin Wan 来源:《自然—遗传学》 发布时间:2013-12-12 14:21:36
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药物“压力”令结核杆菌产生大量突变
 
近日,来自中科院生物物理所、深圳华大基因研究院等单位的科研人员对161株结核分枝杆菌(以下简称结核杆菌)进行了全基因组测序及系统分析。他们发现,在抗结核杆菌药物的压力下,结核杆菌基因组中产生了一批新基因及突变,以应对严峻的“生存形势”。相关成果日前在线发表于《自然—遗传学》杂志。
 
肺结核是一种由结核杆菌引发的慢性呼吸道传染病,全球约有三分之一的人群感染了结核杆菌。我国的结核发病率位居世界第二,耐多药率为5.7%,高于5.3%的世界平均水平。目前,结核杆菌耐药机制已成为结核病研究中的热点和难点。
 
在此次研究中,科研人员对来自中国12个省份的161株结核杆菌(包括44株敏感菌、94株多重耐药菌、23株广泛耐药菌)进行了基因组测序及分析,并通过与H37Rv结核杆菌基因组比较,建立了全基因组范围内的系统发生树。研究发现,这些耐药株大部分来源于第二、四谱系,其中第二谱系的菌株主要来源于东亚,第四谱系的菌株主要来源于欧洲、南北美洲以及非洲。此外,研究人员通过比对发现,第二、四谱系中都存在着大量单核苷酸多态性(SNPs)突变。
 
在排除谱系相关的SNPs突变后,研究人员对多重耐药菌株、广泛耐药菌株和药物敏感型菌株基因组进行比较,共发现了72个新基因、28个基因间隔区、11个非同义SNPs和10个与耐药相关的IGR SNPs。
 
专家表示,该研究建立了一个近乎完整的结核杆菌耐药相关基因库,为结核杆菌耐药性发生机理及相关药物研究提供了思路。(来源:中国科学报 黄明明)
 
 
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