作者:张章 来源:中国科学报 发布时间:2016/6/30 8:07:00
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美模型生物学数据库陷经费困境

数据库包含果蝇等模型生物信息。图片来源:stockstudioX/Getty

美国近日计划整顿和削减国立卫生研究院(NIH)负责支撑的5个模型生物数据库的经费。这一提议遭到研究人员的强烈反对。

46位研究人员签署的公开信提到,这些数据库收纳了出芽酵母、苍蝇、蛔虫、斑马鱼和老鼠等物种的丰富数据,以促进生物学和人类疾病研究发展。数据库还包含了模型生物体遗传和生物学信息,例如基因、蛋白质、基因表达等数据。另外,数据库也纳入了分析工具信息。

“NIH在过去20年里对模型生物数据库的支持促进了一系列重要发现的产生。我们希望它能继续保持这一远见卓识,支持重要的研究基础设施。”研究人员在这封提交给NIH院长Francis Collins的信中提到。

今年5月,美国国家人类基因组研究所(NHGRI)官员表示,该机构计划逐步削减上述数据库的经费,在明年年初减幅达30%~40%。NHGRI在本财年为5个数据库划拨了1760万美元经费。

据悉,NHGRI正希望从NIH其他研究所获得经费,帮助运营这些数据库。此外,在马里兰州举行的一次会议上,NHGRI官员提出要求数据库主要负责人在数月内提交整合计划,以合并这些数据库的某些特征。在未来几年,该机构计划完全合并这些数据库。

“我知道研究界存在许多担忧,但我们需要更广泛的支持,以便将数据库建设得更好。目前,我们已经无法负担这项工作。”NHGRI计算基因组学和数据科学项目负责人Valentina Di Francesco说。她还表示,每个数据库独立运营会让用户感到混乱。“用户应该能用一个界面提取所有需要的数据。”Di Francesco说。

但也有人表示反对。加州大学伯克利分校发育生物学家David Bilder提出,每个数据库包含一些特征,无法在其他地方复制。“我们并不反对融合,但呼吁整个工作应经过深思熟虑,以保证数据库的高质量和实用性。”他说。(张章)

《中国科学报》 (2016-06-30 第3版 国际)
 
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