作者:马晓岚 来源:科学网 www.sciencenet.cn 发布时间:2016/6/10 11:11:14
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人和未来加速基因数据分析 助推精准医疗

 

2016年6月8日,人和未来生物科技有限公司(Genetalks,以下简称“人和未来”)受邀参加第二届“精准医疗时代的协作创新——2016英特尔生命科学信息技术论坛”,公司CTO宋卓博士出席论坛并发表演讲。作为世界首家将FPGA加速技术应用于基因检测实践的生物科技企业,宋卓博士在论坛上对其公司最新产品GTX One进行了主题演讲,同时宣布人和未来加入Intel精准医疗合作伙伴(Intel BioIT Partners)计划,正式成为英特尔合作伙伴。

通过GTX One的主题演讲,宋卓博士指出随着基因测序技术的发展,数据的生成能力已经逐渐超过及时分析数据的能力,基因检测的计算加速势在必行;与常规的加速手段相比,FPGA硬件加速相当于将一台超级计算机放入一个小盒,有了它的协助一台普通PC就能解决当下生物计算遭遇的性能瓶颈。

资料显示,GTX One是人和未来最新上线的研发产品,该系统是专门针对基因数据分析的高耗时计算流程开发、以FPGA加速芯片为核心的通用计算加速平台。GTX One系统主要由交互界面、FPGA加速卡和计算软件三部分组成,是全球首个将FPGA加速技术应用于基因检测并提供数据解读的分析平台。

据专家介绍,精准医疗的实现,需要基因测序技术、生物信息学与医疗大数据科学的跨学科交叉发展。若要实现精准医疗,就必须采集海量的数据,而及时分析这些海量数据,就必须要先突破计算的瓶颈。人和未来此次将FPGA硬件加速与基因检测计算相结合,成功设计了GTX One加速系统。通过算法创新充分释放FPGA的计算能力,达到了比高性能至强CPU服务器快100倍的计算性能,大大加速了海量基因数据的处理。GTX One较之于之前的系统具有高效率、高精度、低功耗的特点。

此次论坛上,中国科学院院士、北京大学医学部主任詹启敏在演讲中指出:“医疗没有工具,光靠经验是不行的”、“在未来大数据库中,健康数据肯定是最大的数据”。作为大数据的重要组成部分,基因检测技术的发展势必影响整个产业的前进。

人和未来CTO宋卓博士在演讲中也表示:“加速不是目的,只是手段。懂应用的加速才是好的加速产品。”加速是为了帮助人们更快更及时的去解读基因密码信息。目前,在无创产前遗传疾病筛查领域,GTX One已经取得了早期应用测试者对于速度和准确度的认可。人和未来预计会随后推出全基因组、全外显子组等更多的加速应用,继续丰富GTX One平台上的应用种类。

6月7日在北京丽都维景酒店开幕的第二届“精准医疗时代的协作创新——2016英特尔生命科学信息技术论坛”,是一年一度的精准医疗计算行业盛事,集合了国内外在生物科技领域前沿的企业领导人、科研专家以及信息技术人才。本次论坛同时倡导发起成立了“中国精准医疗计算创新伙伴计划”(China BioIT Partners),旨在推动BT+IT技术在医疗和生命科学上的结合应用、创新解决方案、案例示范,促进中国精准医疗行业跨行业合作和交流,及相应行业计算和应用方面标准的建立,人和未来作为生物科技和精准医疗的行业新秀,成为英特尔“中国精准医疗计算创新伙伴计划”的首批成员。

据了解,人和未来生物科技(北京)有限公司于2014年7月在北京成立,由归国博士、硕士及行业专家组成,从成立至今一直致力于遗传病和癌症的基因检测、诊断的技术转化,提供安全高效的临床解决方案和全面客户支持。公司专注于基因检测和高性能计算技术在生命科学研究和人类健康领域的应用,已在湖南长沙拥有专注于基因检测的第三方医学检验所。

人和未来通过与Illumina,Wafergen等国内外知名公司的战略合作,建设了包括高通量基因测序、高通量基因芯片、高通量荧光定量PCR、毛细管电泳测序、全自动核酸提取及建库等诸多国内领先的基因检测平台。公司凭借在超低频突变检测及生物信息处理方向的领先专利技术,成功推出肿瘤ctDNA、BRCA1/2、无创产前、易感基因检测等专业检测,并在国内市场率先推出了下一代生物信息计算平台(FPGA加速芯片)和基于文本挖掘的信息分析云服务,实现了高通量测序技术以及计算应用在科研、临床到健康管理的多元化市场布局。

 
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