本报讯（记者李晨）中国农业科学院郑州果树研究所西瓜甜瓜种质资源团队对196份西瓜核心种质进行了SV-GWAS分析，在西瓜6号染色体上锁定一个调控西瓜种子大小的拷贝数变异。通过基因组比对发现，该变异在大籽材料中为单拷贝，在小籽材料中为四拷贝串联重复。相关成果近日在线发表于《植物通讯》。

种子大小是作物驯化中的重要农艺性状，对作物品质和产量提升有重大意义，也是西瓜育种的核心改良性状。然而，决定西瓜种子大小的关键遗传变异及背后的分子调控机制仍是未解之谜，极大阻碍了小籽鲜食西瓜的培育。

新发现的变异虽不直接编码蛋白，却能直接激活一条全新长链非编码RNA，进而上调下游多药及毒素外排转运蛋白编码基因，通过降低生长素水平抑制细胞生长，最终使种子变小。

这项发现首次将拷贝数变异、长链非编码RNA与种子大小调控联系起来，为小籽西瓜品种的分子育种提供了可直接利用的基因靶点，对培育更符合市场消费习惯的小籽西瓜具有重要指导意义。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1016/j.xplc.2026.102028