《自然-生物技术》

人视网膜类器官发育的多模态时空表型研究

瑞士巴塞尔罗氏创新中心的J. Gray Camp和其他人员共同研究了人视网膜类器官发育的多模态时空表型。相关研究成果近日在线发表于《自然-生物技术》。

据介绍，由人类多能干细胞产生的类器官为研究发育和疾病提供了实验系统，但缺乏不同空间尺度和分子模式的定量测量。

研究人员生成了视网膜类器官时间过程和原发性成人视网膜组织的多重蛋白质图谱。研究人员开发了一个工具包来可视化祖细胞和神经元的位置、细胞外和亚细胞成分的空间排列以及每个类器官和原代组织中的全局模式。

此外，研究人员还生成了一个单细胞转录组和染色质可及性时间进程数据集，并推断了类器官发育的基因调控网络。研究人员将具有空间分割细胞核的基因组数据整合到多模式图谱中，以探索类器官模式和视网膜神经节细胞（RGC）空间邻域，突出了RGC死亡的相关途径，并表明视网膜类器官中的嵌合遗传扰动为细胞命运调控提供了见解。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1038/s41587-023-01747-2

《科学进展》

大型溪流无脊椎动物密度下降

美国圣母大学Samantha L. Rumschlag研究组提出了大型溪流无脊椎动物密度下降、丰度增加、组成发生变化的观点。相关论文近日发表于《科学进展》。

研究人员分析了历经27年、超过500个属的生物多样性和组合的组成。它们的分布地点包括美国森林、草原、城市和农业用地的6131个溪流点。数据集显示，相对而言，27年以来，大型无脊椎动物密度下降了11%、丰度增长了12.2%，昆虫密度和丰富性分别下降了6.8%和23.3%。

此外，随着时间的推移，城市和农业溪流与森林和草原溪流之间的丰度和组成差异也在增加。城市和农业溪流失去了它们曾经拥有的少数对干扰敏感的分类群，而获得了耐干扰的分类群。研究结果表明，目前保护和恢复河流的努力不足以减轻人类活动的影响。

据介绍，大型溪流无脊椎动物的生物多样性受到挑战，因为生物监测通常具有有限的空间时间和分类范围。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1126/sciadv.adf4896