来源: 中国科学报 发布时间:2022-1-11
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《免疫》

丙肝病毒分析发现广泛中和遗传决定因素

德国科隆大学Florian Klein研究团队通过分析丙型肝炎病毒(HCV)的中和抗体,揭示了广泛中和的遗传决定因素。相关论文近日在线发表于《免疫》。

研究人员对435名HCV感染者的队列进行了筛选,发现2%~5%的人表现出突出的HCV中和活性。从这些患者中的4位,研究人员分离出310个HCV抗体,包括具有特殊广度和效力的中和抗体。高中和活性是通过使用VH1-69重链基因段、CDRH1内的体细胞突变和CDRH2的疏水性实现的。结构和突变分析显示,取代第30位和31位丝氨酸的突变具有重要作用,而且CDRH3顶端存在中性和疏水性残基。

基于这些特征,研究人员通过计算创建了一个具有完全合成的VH1-69重链的新抗体,它能有效中和多种HCV基因型。这些发现使人们对广泛HCV中和抗体的产生有了深入了解,并可以指导有效候选疫苗的设计。

据悉,HCV的高度遗传多样性使有效的疫苗开发变得复杂。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1016/j.immuni.2021.12.003

研究揭示血小板转录因子功能

美国波士顿儿童医院Ivan Zanoni研究组发现,在活化血小板中抑制转录因子NFAT的活性增强了血小板聚集,并加剧了由革兰氏阴性细菌引发的败血症。该项研究成果发表在近日出版的《免疫》上。

研究人员发现凝血酶信号诱导血小板中转录因子NFAT的激活。使用遗传和药理学方法,以及新开发的小鼠模型iNFATuation(该小鼠可抑制细胞特异性NFAT激活)研究人员发现在激活的小鼠和人血小板中,抑制NFAT增强了血小板的激活和聚集,以及它们与中性粒细胞和性粒细胞胞外陷阱(NET)诱导的相互作用。在革兰氏阴性菌诱导的败血症中,抑制血小板中NFAT通过增加弥散性凝血和NETosis加剧了疾病的严重程度。NFAT抑制也部分恢复了血小板活性减退患者的体外凝血。该研究结果揭示了NFAT的非转录作用,可用于解决紧迫的临床需求。

据悉,在由革兰氏阴性菌诱导的败血症中,血小板和中性粒细胞之间的相互作用诱导了一个有害的反馈回路,导致持续性NET、弥散性血管内凝血和炎症。了解控制血小板—中性粒细胞相互作用的细胞内途径,对于确定新的治疗靶点至关重要。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1016/j.immuni.2021.12.002

《自然—神经科学》

下丘脑黑色素浓缩激素调节海马背外侧隔活动

美国罗格斯大学Zhiping P. Pang研究组发现,下丘脑黑色素浓缩激素调节海马背外侧隔活动。《自然—神经科学》日前在线发表了这项成果。

研究人员在小鼠身上发现了下丘脑黑色素浓缩激素(MCH)信号在背外侧隔膜(dLS)投射中功能作用的生理机制,该区域参与海马发射节律和基于这种节律的空间记忆编码。dLS内响应背侧CA3(dCA3)兴奋的发射活动受到强烈的前馈抑制(FFI)的限制。

研究人员发现,MCH通过增强GABA的释放,使dLS神经元的发射与dCA3的输入同步,从而降低FFI并增强dCA3的兴奋性输入强度,这两者都是通过突触前机制实现的。在功能层面上,这些数据揭示了MCH信号在dLS中促进空间记忆的作用。这些发现表明,dLS内的肽能信号调节海马背侧的输出并支持记忆编码。

据了解,MCH多肽有助于调节能量平衡、睡眠和记忆,但其影响的机制基础尚不清楚。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1038/s41593-021-00984-5

《自然—生物技术》

用深度分布式计算重建大型谱系树

日本东京大学Nozomu Yachie研究团队表明,深度分布式计算可用来重建大型谱系树。这一研究成果近日在线发表于《自然—生物技术》。

研究人员提出了一个深度分布式计算框架来全面追踪准确的大型谱系(FRACTAL),该方法大大增强了当前谱系估计软件工具的可扩展性。FRACTAL首先只重建输入序列的上游谱系,然后使用独立的计算节点对其下游谱系进行递归迭代,从而产生同样的结果。研究人员通过在大于2.35亿个模拟序列和大于1600万个细胞中重建谱系,证明了FRACTAL的实用性,这些细胞来自一个在细胞增殖期间积累突变的CRISPR系统的模拟实验。研究人员还成功地将FRACTAL应用于进化树的重建和使用易错PCR进行大规模序列多样化的实验。

据介绍,系统发育估计(进化树的重建)最近被应用于基于CRISPR的细胞系追踪,其能够从体细胞的大量突变序列中推断出单个组织或生物体的发育历史。然而,目前的计算方法无法从极大量的输入序列中构建系统发育树。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1038/s41587-021-01111-2

《中国科学报》 (2022-01-11 第2版 国际)
 
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