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DNA文献清单:读懂癌症基因——从家族遗传到个性化治疗的文献荐读 |
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期刊名:DNA
期刊主页:https://www.mdpi.com/journal/dna
本期为您精选 DNA 期刊基因和癌症相关的 8 篇热门综述与原创论文,涵盖研究进展、作用机制、临床应用与未来展望四个层面,希望与读者分享领域内最新研究成果,为相关研究人员提供新思路与新参考,欢迎阅读。
Genetic Basis of Familial Cancer Risk: A Narrative Review
家族性癌症风险的遗传基础:叙述性综述
http://www.mdpi.com/2673-8856/6/1/5
Fares Sabik, E. Genetic Basis of Familial Cancer Risk: A Narrative Review. DNA 2026, 6, 5. https://doi.org/10.3390/dna6010005
家族性癌症源于调控细胞生长、分裂与修复的基因发生胚系突变,这类突变可代代相传,使约 5%–10% 的癌症具有遗传成分,个体的患癌易感性因此升高。突变主要涉及抑癌基因与癌基因两大类,二者一旦异常,细胞的正常行为便会失控,最终走向不受约束的增殖和肿瘤形成;值得注意的是,DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 失调等表观遗传改变,也能在不改变 DNA 序列的情况下参与其中。家族性癌症综合征遵循常染色体显性、常染色体隐性、X 连锁和线粒体等多种遗传模式,各有特点。正因如此,识别与家族性癌症相关的基因突变便成为遗传咨询的基石,它帮助个体与家庭厘清遗传、患癌风险与预防之间的复杂关系,而早期识别突变更是能推动个性化降险、早筛乃至靶向治疗的落地,最终改善患者预后。

Overview of Roles of Novel Components in the Regulation of DNA Damage Repair in BRCA1-Deficient Cancers: An Update
BRCA1缺陷型癌症中DNA损伤修复调控新组分的作用概述:最新进展
http://www.mdpi.com/2673-8856/5/2/17
Nguyen, N.; Arris, D.; Tran, M.T. Overview of Roles of Novel Components in the Regulation of DNA Damage Repair in BRCA1-Deficient Cancers: An Update. DNA 2025, 5, 17. https://doi.org/10.3390/dna5020017
由 BRCA1 胚系突变引发的癌症,因 BRCA1 是同源重组(HR)DNA 修复的关键因子,对铂类和 PARP 抑制剂(PARPis)等 DNA 损伤剂较为敏感。越来越多证据表明,BRCA1 还是细胞周期各阶段的重要驱动因素,维持细胞周期进程的有序进行;其活性缺失会导致 S 期、G2/M 期、纺锤体检查点及中心体复制失调,从而阻断细胞增殖并诱导凋亡。在脊椎动物中,BRCA1 和/或 BRCA2 等 HR 基因缺失是致死的,因为 HR 是基因组完整性的前提;因此癌细胞会利用非同源末端连接(NHEJ)等替代性 DNA 修复途径来应对 BRCA1 功能缺失。本综述旨在更新并讨论这些新组分在 BRCA1 缺陷型癌症 DNA 损伤修复(DDR)调控中的关键作用。

Evolution of Acquired Drug Resistance in BRAF-Mutant Melanoma
BRAF突变型黑色素瘤获得性耐药性的演变
http://www.mdpi.com/2673-8856/4/4/25
Ballesteros-Álvarez, J.; Blázquez-Medela, A.M. Evolution of Acquired Drug Resistance in BRAF-Mutant Melanoma. DNA 2024, 4, 355-369. https://doi.org/10.3390/dna4040025
黑色素瘤是一种高度侵袭性的皮肤癌,转移性黑色素瘤的预后历来极差,甚至一度被视为不可治愈。近年来靶向治疗的突破彻底改写了这一格局,显著延长了患者的总体生存 —— BRAF 过度激活是转移性黑色素瘤最常见的突变事件,抑制 BRAF 在相当一部分患者中已证明有效。然而遗憾的是,多数患者在初始肿瘤退缩后仍会复发,这凸显了寻找广谱有效疗法的困难。黑色素瘤肿瘤往往携带极高数量的突变,呈现高水平的患者间与患者内肿瘤异质性,成为耐药的驱动因素;这些突变不仅影响恶性肿瘤的根本成因与治疗干预的可行性,还会在肿瘤克隆演化过程中不断产生,最终确立获得性耐药 —— 这正是黑色素瘤临床管理面临的核心难题。

Targeting Thyroid Hormone Receptor Interacting Protein (TRIP13) for Cancer Therapy: A Promising Approach
以甲状腺激素受体相互作用蛋白 (TRIP13) 为靶点的癌症治疗:一种有前景的方法
http://www.mdpi.com/2673-8856/5/1/3
Singh, S.P.; Goswami, K.; Pathuri, G.; Rao, C.V.; Madka, V. Targeting Thyroid Hormone Receptor Interacting Protein (TRIP13) for Cancer Therapy: A Promising Approach. DNA 2025, 5, 3. https://doi.org/10.3390/dna5010003
TRIP13 是 AAA+ ATPase 蛋白超家族的重要成员,在有丝分裂中负责染色体的精确分离。其功能一旦异常,便会波及有丝分裂进程、DNA 修复通路与纺锤体组装检查点,进而可能诱发染色体不稳定(CIN)——而 CIN 被认为是肿瘤发生与演进的关键推手。越来越多的证据表明,TRIP13 在多种癌症中过表达,并在耐药、自噬以及免疫逃逸中扮演重要角色。近年来,与癌症进展相关的 TRIP13 信号通路不断被揭示,多种能特异性抑制 TRIP13 功能、抑制癌细胞生长的小分子药物已相继开发,TRIP13 抑制剂与其他抗癌药的联合治疗方案也展现出可喜前景 —— 不过这些抑制剂目前仍在等待进入临床试验。这篇综述系统梳理了 TRIP13 促癌功能的最新研究进展及其潜在治疗靶点,提示它有望成为癌症管理中的一个有吸引力的新选项。

DNA Triplex-Formation by a Covalent Conjugate of the Anticancer Drug Temozolomide
抗癌药物替莫唑胺共价缀合物形成DNA三链体
http://www.mdpi.com/2673-8856/5/3/36
Walsh, A.J.; Fraser, W. DNA Triplex-Formation by a Covalent Conjugate of the Anticancer Drug Temozolomide. DNA 2025, 5, 36. https://doi.org/10.3390/dna5030036
替莫唑胺是治疗多形性胶质母细胞瘤(成人最常见的原发性脑恶性肿瘤)的重要药物。研究者设想,将替莫唑胺共价偶联到可形成三链体的寡核苷酸上,有望在靶向 DNA 时实现更好的序列选择性,从而减少脱靶效应、降低传统化疗的副作用。但替莫唑胺对碱敏感,无法耐受寡核苷酸固相合成中常规的碱性脱保护条件,为此研究团队开发了一种新型二异丙基亚硅烷基连接的固相载体,并建立相应条件,成功制备出完全脱保护的固相寡核苷酸用于衍生化,连接子可在温和酸性条件下裂解释放。最终结果表明,该固相载体与碱敏感寡核苷酸偶联物的合成完全兼容,且替莫唑胺 - 寡核苷酸偶联物形成的 DNA 三链体,其稳定性与未偶联的对照相当 —— 这为替莫唑胺向特定 DNA 序列的选择性递送开辟了新的可能。

Methylation Profile of DAPK-1 Between Oral Potentially Malignant Disorders and Oral Squamous Cell Carcinoma
口腔潜在恶性疾病与口腔鳞状细胞癌中DAPK-1的甲基化谱
http://www.mdpi.com/2673-8856/4/4/33
Papadopoulos, P.; Zisis, V.; Andreadis, D.; Parlitsis, D.; Louizou, E.; Tsirtsaki, A.; Rapti, S.M.; Tsitsopoulos, S.; Vahtsevanos, K.; Poulopoulos, A. Methylation Profile of DAPK-1 Between Oral Potentially Malignant Disorders and Oral Squamous Cell Carcinoma. DNA 2024, 4, 494-506. https://doi.org/10.3390/dna4040033
DAPK-1(死亡相关蛋白激酶 1)是可能受 DNA 高甲基化影响的抑癌关键分子。这项研究旨在比较口腔潜在恶性疾病(OPMDs)与口腔鳞状细胞癌(OSCC)中 DAPK-1 基因的甲基化状态,评估其作为口腔病变早期恶性转化指标的价值。研究者对收集的 83 例 OPMDs、39 例 OSCC 及 12 例正常口腔上皮样本进行甲基化特异性 PCR 检测,结果令人瞩目:39 例 OSCC 样本的 DAPK-1 启动子区全部发生甲基化,而正常组织中仅 2/12 出现高甲基化(p<0.001);83 例 OPMDs 中有 17 例检测到 DAPK-1 甲基化,且多集中于糜烂型口腔扁平苔藓、非异常增生及轻度异常增生的白斑等早期病变阶段。由于表观遗传改变发生在癌变早期且具有潜在可逆性,该研究提示 DAPK-1 甲基化有望成为口腔癌诊断、预后与预测的生物标志物乃至治疗靶点 —— 它在早期异常增生阶段和所有口腔癌病例中几乎普遍存在,或能成为预警恶变转化的早期信号。

Mutational Profiling of Medullary Thyroid Carcinoma via a Large-Scale Genomic Repository
利用大规模基因组库对甲状腺髓样癌进行突变谱分析
http://www.mdpi.com/2673-8856/5/3/35
Hsia, B.; Torbenson, E.; Lang, N.; Silberstein, P.T. Mutational Profiling of Medullary Thyroid Carcinoma via a Large-Scale Genomic Repository. DNA 2025, 5, 35. https://doi.org/10.3390/dna5030035
甲状腺髓样癌(MTC)是一种源于甲状腺滤泡旁 C 细胞的神经内分泌肿瘤,晚期治疗颇具挑战。尽管 RET 原癌基因突变是已知的驱动因素,但对其更广泛的体细胞突变全景仍缺乏认识。这项研究利用 AACR Project GENIE 大型基因组数据库,对 341 例 MTC 样本进行了回顾性突变谱分析:结果确认 RET 突变占据主导(75.7%,以 M918T 为主),其次为 HRAS(10.0%)和 KRAS(5.6%),且 RET 与 RAS 改变呈互斥关系;复发性突变还包括 KMT2D、CDH11、ATM 和 TP53 等。值得注意的是,NOTCH1 突变在转移性病例中显著富集,提示其可能在疾病进展中发挥作用;此外还观察到 ATM 突变与较长生存相关,BARD1/BLM/UBR5/MYH11 则与较短生存相关。不过这些人口学与生存关联尚属初步发现,受亚组样本量限制有待验证。该研究夯实了 MTC 的基因组基础,也凸显了整合临床 - 基因组数据以优化治疗策略的必要性。

Advancing Liver Cancer Treatment Through Dynamic Genomics and Systems Biology: A Path Toward Personalized Oncology
通过动态基因组学和系统生物学推进肝癌治疗:迈向个性化肿瘤学之路
http://www.mdpi.com/2673-8856/6/1/6
Colonna, G. Advancing Liver Cancer Treatment Through Dynamic Genomics and Systems Biology: A Path Toward Personalized Oncology. DNA 2026, 6, 6. https://doi.org/10.3390/dna6010006
这篇综述以跨学科视角,探讨动态基因组学与系统生物学如何重塑现代医疗,并将焦点落在肝癌(肝细胞癌,HCC)上。它指出,整合基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学乃至空间转录组学等多组学技术,能够加深对复杂肿瘤微环境的理解,并基于分子、空间与功能特征实现精准的患者分层,从而制定个体化治疗方案。借助多组学数据绘制调控网络与细胞特异性通路,有望预测耐药、识别治疗靶点并推动靶向药物开发,使治疗从统一治疗的标准化方案,转向由液体活检、可穿戴生物传感器等技术支撑的灵活实时策略。文中以一例整合表观遗传修饰、免疫检查点抑制剂与持续多组学监测的 HCC 患者为例,展示了个性化治疗的获益;并展望了云端基因组生态系统、保护隐私的联邦学习及 AI 驱动数据分析等未来方向。综述同时梳理了采用先进分子与免疫学方法的 HCC 临床试验,总体倡导一种系统性、技术化、空间化的肿瘤治疗范式,强调实验与生化功能及生物物理数据驱动的洞察在个性化医疗中的核心价值,推动医疗向预测性与预防性转变。

DNA 期刊介绍
主编:Prof. Dr. Yves Pommier; Developmental Therapeutics Branch and Laboratory of Molecular Pharmacology Center for Cancer Research, NCI, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892, USA
DNA期刊致力于发表DNA、DNA相关技术、基因组结构、生物信息学及细胞基因组学领域的创新性研究成果、综述文章与研究简报,秉持最高科学水准的办刊准则,并坚守 “从序列到表型影响” 的核心理念。本刊旨在鼓励科研人员发表具备最广泛科学影响力的研究成果,重点聚焦那些 DNA 序列与结构的变化会产生表型效应的研究 —— 这类效应既体现在个体层面(包括临床应用领域),也会作用于物种演化过程。
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