作者:Joseph Guhlin 来源:《自然—生态与进化》 发布时间:2023/8/29 17:00:47
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基因组测序拯救鸮鹦鹉

 

在新西兰五个没有捕食者的岛屿上,大约现存250只鸮鹦鹉  图片来源:Lydia Uddstrom

为了保护极度濒危的新西兰鸮鹦鹉kakapo,几乎所有剩余个体的基因组都已被测序,这为其保护管理提供了重要信息。

新西兰鸮鹦鹉kakapo(Strigops habroptila)有几个特性。它是世界上最重的鹦鹉,有的雄性甚至超过3公斤,被认为有达90年的最长寿命。它是唯一一种不会飞的鹦鹉,通过爬树或在地上觅食,以此来寻找坚果和种子等食物。

这种绿色的鸟类曾经在新西兰广泛分布,但几乎被猫和老鼠等捕食者彻底消灭。剩下的个体有250只左右,由新西兰保护部与五个无捕食者岛屿上的毛利人团体合作管理。

Kakapo种群规模小,防止近亲繁殖具有挑战性。个别鸮鹦鹉经常被转移到不同的岛屿,以增加整体种群的遗传多样性,这对适应未来的威胁很重要。然而,直到最近,研究人员还很难确定应该转移哪些鸮鹦鹉。

为了帮助做出决定,新西兰奥塔哥大学的Joseph Guhlin和Peter Dearden及同事对约90%现存鸮鹦鹉的全基因组进行了测序。

Guhlin说,保护部现在正在利用这些信息,根据基因亲缘关系来决定哪些个体应该移至其他岛屿。他说:“这意味着它们可以优先进行转移,以增加亲缘关系不密切的个体之间交配的机会。”

该部门还利用这些信息挑选了四个鹦鹉,并于上个月将它们重新移至新西兰北岛,此前它们已离开新西兰50年。Dearden说,被选中的个体有相当标准的基因组,这意味着“它们可以负担重新登陆新西兰的风险,因为它们没有携带罕见的变异基因。”

对鸮鹦鹉的基因组进行测序,使研究人员能够识别出与健康特征相关的某些遗传变异,如它们产卵的数量、幼崽生长速度和疾病易感性。Dearden说,这些信息可能被用来识别具有更高“遗传价值”的个体,如果需要的话,这些个体可能会在未来用于伴侣配对,或者识别需要更多照顾的弱势个体。

Guhlin说,通过对种群中所有个体的基因组进行测序,特别是在测序成本下降的情况下,可以帮助保护其他极度濒危物种。“我们希望这能成为其他保护行动的蓝图,”他说。

研究人员在8月28日出版的《自然-生态与进化》上发表了这一研究成果。(来源:中国科学报 郭悦滢)

相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41559-023-02165-y

 
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