作者:李晨,马昕怡 来源:中国科学报 发布时间:2024/5/15 18:42:49
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首个人参完整基因组发布

 

近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业生物转录组与代谢组创新团队发表了首个人参端粒到端粒完整基因组,解析了重要活性成分三萜皂苷多样化的形成机制。相关研究成果发表于《园艺研究》(Horticulture research)。

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实验用人参。中国农科院供图

人参被誉为“百草之王”,具有重要药用价值。三萜皂苷是其主要活性成分之一,对中枢系统和心脑血管具有显著保护作用。

由于人参是异源四倍体,遗传背景复杂。研究人员结合多种测序技术构建了人参完整基因组,基因组大小为3.45Gb,完整性评估为99.3%,鉴定到了48个端粒,预测了24个着丝粒,大幅提升人参基因组的连续性、完整性和准确性。

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人参完整基因组。中国农科院供图

在此基础上,研究进一步探究了异源四倍体形成过程中人参皂苷合成基因的不平衡进化,发现串联重复和近端重复在人参皂苷的生物合成中发挥了关键作用,并证明了亚基因组优势现象在人参中的存在。该研究为人参优异种质选育和生物合成人参三萜皂苷奠定了理论基础。

该研究获得国家重点研发计划、吉林省科技发展计划等项目的资助。 

相关论文信息:https://doi.org/10.1093/hr/uhae107

 
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