北京农学院植物科学技术学院教授秦岭、邢宇团队通过全基因组关联分析(GWAS)对板栗6个产量相关的园艺性状进行分析,揭示了板栗果实相关产量性状的遗传基础,为板栗育种提供了有价值的信息和见解。日前,相关研究发表在《植物生理》上。
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板栗样品。课题组供图
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板栗。课题组供图
板栗是重要的木本粮食作物,由于其较高的营养价值和对贫瘠土壤的耐受性,在山区广泛种植。近年来对板栗的研究主要集中在性状相关性分析、分子标记开发以及对栗疫病的抗性方面,缺少与产量直接相关的性状(种子大小)和间接相关性状(叶片长度)的遗传结构分析和基因功能的验证。近年来,课题组公布了板栗第一个基因组,构建了板栗愈伤瞬时转化体系,为实现基因功能的快速鉴定奠定基础。
本研究广泛收集了151份中国板栗品种(系),并对其进行简化基因组测序。群体遗传学结果表明,中国板栗品种可分为南北两个生态型。通过对两种生态型群体全基因组水平受选择信号分析,鉴定到可能影响板栗性状和环境适应性的串联排列基因。为进一步探究板栗产量相关性状形成,对151个品种(系)的6个重要园艺性状进行了全基因组关联研究。鉴定出45个高度相关的QTL,筛选出6个与这些性状高度相关的基因,包括影响板栗单粒重的候选基因CmAP2和叶长的候选基因CmCIB1。利用基因沉默和过表达技术对其进行功能验证,发现CmAP2通过负调控细胞大小影响种子大小,CmCIB1则是通过影响细胞的长度影响叶片和新梢的长度。
据悉,秦岭和邢宇为论文通讯作者,北京农学院和北京林业大学联合培养博士生张煜、北京农学院博士张伟伟和刘阳为论文第一作者。
相关论文信息:https://doi.org/10.1093/plphys/kiad674
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