在国家自然科学基金和广东省特支计划项目的资助下,华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队通过对上百种植物进行大规模的PHAS(产生phasiRNA的基因/位点)分析,发现生殖phasiRNAs(phased siRNA,相位siRNA )具有常规以外的异常产生模式。相关研究近日在线发表于Plant Biotechnology Journal。
目前为止,miR2275被认为是触发非编码PHAS基因位点产生24-nt生殖phasiRNAs的主要trigger。miR2275靶向大量在减数分裂花药中优先表达的非编码RNA(PHAS前体),并刺激24-nt phasiRNAs的产生。然而,研究人员在荔枝中发现一个例外情况:miR2275被发现靶向一个蛋白质编码基因,并触发大量21-nt phasiRNAs的产生。
而在水稻中,miR167靶向ARF6基因(LOC_Os02g06910),在非生殖组织中(如叶片)触发产生大量的21-nt phasiRNAs;而在生殖组织花药中,则引起产生24-nt的phasiRNAs。这些特例表明,生殖phasiRNAs可以从蛋白质编码基因产生,并且相同的PHAS基因/位点可以被相同的miRNA trigger触发产生两种不同类型的phasiRNAs。同时,在野生草莓中,miR11308在同一组织中,可以从一些PHAS基因位点上同时触发产生21-nt和24-nt两种类型的phasiRNAs。
该研究发现表明植物中生殖phasiRNAs的生物合成过程具有比我们已知的更大的灵活性,拓宽了我们对生殖phasiRNAs生物发生的理解,有助于将phasiRNA途径开发成有效的生物技术工具引入到植物基因的人工沉默技术中。
相关论文信息:https://doi.org/10.1111/pbi.13953
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