基金委先后与国际农业研究磋商组织（CGIAR）下属8个中心（研究所），即国际生物多样性中心（Bioversity）、国际热带农业中心（CIAT）、国际玉米小麦改良中心（CIMMYT）、国际马铃薯中心（CIP）、世界农用林业中心（ICRAF）、国际食品政策研究所（IFPRI）、国际家畜研究所（ILRI）以及国际水稻所（IRRI）达成了合作共识，共同资助双方科学家开展合作研究。2013年经过公开征集、同行评议和专家组的评审，以下9个项目获得批准，资助经费总计1970万元，实施周期为5年（2014年1月1日-2018年12月31日）：
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序号
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项目名称
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申请人
依托单位
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CGIAR方合作者
CGIAR方合作单位
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1
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木薯种质资源转录组与蛋白质组分子评价及品种高效选育研究
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陈松笔
中国热带农业科学院
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Hernán Ceballos
国际热带农业中心（CIAT）
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2
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有机结合连锁和关联分析剖析玉米籽粒营养品质的遗传基础
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杨小红
中国农业大学
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Buba Roman
国际玉米小麦改良中心（CIMMYT）
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3
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基于关联分析和连锁分析的小麦抗叶锈病基因分子定位
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李在峰
河北农业大学
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Singh Ravi
国际玉米小麦改良中心（CIMMYT）
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4
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玉米氮和磷高效利用与耐贫瘠优异基因资源发掘与验证
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谢传晓
中国农业科学院作物科学研究所
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Prasanna Boddupalli M
国际玉米小麦改良中心（CIMMYT）
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5
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气候变化对农用树种植物—土壤反馈系统的作用
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余世孝
中山大学
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Barrios Edmundo
世界农用林业中心（ICRAF）
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6
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四个东南亚猪种免疫及生长性状全基因组关联分析与特色基因挖掘
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赵书红
华中农业大学
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Kemp Steve
国际家畜研究所（ILRI）
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7
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全球气候变化之增温对水稻产量和品质形成及氮代谢与氮效率的影响及机理研究
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黄见良
华中农业大学
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Jagadish Krishna
国际水稻所（IRRI）
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8
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变化市场中农产品价值链转型及价格、食品安全的互动关系——以蔬菜、渔产品和乳制品为例
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Thomas Reardon
中国人民大学
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Minten Bart
国际食品政策研究所（IFPRI）
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9
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人口变化，城乡人口流动，和中国的农业与农村发展
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钟甫宁
南京农业大学
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DIAO XINS HEN
国际食品政策研究所（IFPRI）
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请中方申请人在收到国家自然科学基金委员会签发的“项目批准通知”和“资助项目计划书填写通知”后，在基金委ISIS系统中按照通知的要求填写和提交项目计划书。
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