4月12日，国际著名医学期刊《新英格兰医学杂志》以《一种源自禽的新甲型流感病毒对人的感染》为题，刊发了我国发现新型人感染H7N9禽流感病毒这一重大发现。
2月底和3月初，作为重大专项哨点医院之一的上海市（复旦大学附属）第五人民医院呼吸科主任揭志军在诊疗过程中，发现一例不明原因重症肺炎患者，他迅速启动会诊程序，并以课题标本形式将该病例的标本送至上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心病原应急检测和生物安全部进行重点检测。
接到这一标本后，复旦大学上海医学院医学分子病毒学重点实验室主任袁正宏研究员和公卫中心实验室主任胡芸文副主任技师作为课题负责人和主要骨干带领实验室团队，立即开展了病原学筛查和进一步的致病原鉴定。经过病原学筛查，未检出新型冠状病毒、SARS冠状病毒和人高致病性禽流感病毒（H5N1）。于是他们推测此病毒不同于目前已知可感染人类的流感病毒，可能是一种新型流感病毒。随即，实验室又采用多种策略扩基因片段并进行序列分析，以搞清病毒基因序列特征和可能的来源。后根据获得的核酸序列和反复的验证，提示此病毒可能是一种以H9型流感病毒为基因骨架，同时含有多种流感基因片段的重配毒株。
取得此突破性进展后，他们在第一时间向上海市卫生局等汇报新型流感病毒研究情况及防控建议，得到上级主管部门的高度重视。
3月22日，上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心实验室在上海疾病预防控制中心的配合下，向中国疾病预防控制中心送检病例标本，实验结果得到中国CDC的复核和确认。
3月29日，中国疾病预防控制中心从患者的标本中分离到H7N9禽流感病毒。3月30日，中国国家卫生和计划生育委员会组织专家，依据病例的临床表现、实验室检测和流行病学调查结果，最终诊断为人感染H7N9禽流感确诊病例。
3月31日,国家卫生和计划生育委员会正式通报此次人感染的H7N9禽流感病毒是全球首次发现的新亚型流感病毒，既往仅在禽间发现。
对于这次新发现的禽流感病毒，该论文表示，新的重配H7N9禽流感病毒的流行潜力不能低估。新型H7N9禽流感病毒还会在什么时间、什么地点以及如何出现，仍没有科学的证据和解释。由于目前该病毒感染造成的高病死率，作者提倡在加强保护措施的同时也要加快针对新H7N9禽流感病毒疫苗和抗病毒药物的研发。最重要的是，由于流感病毒非常容易突变，因此要对该病毒的进化行为密切关注，尤其要严密监测可能在人之间的传播。
此次病毒的及早发现，为我国相关部门有效控制疾病传播提供了最直接的证据，以科研实力证明我国自SARS以来应对新发突发传染病能力有了显著提高。
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