作者:汪海林等 来源:《核酸研究》 发布时间:2014-4-17 16:01:42
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科学家提出基因水平碱基分析新方法
 
日前,中科院生态环境中心汪海林研究组在5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)分析方面取得重要进展,提出了对该物质进行分析的新方法。相关成果近日发表于《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。
 
据了解,5hmC是科学家发现的第六种碱基,已在多种哺乳动物组织和细胞中检出。另外,多种肿瘤中5hmC水平偏低,使其有可能成为肿瘤早期诊断的生物标志物。目前,基因水平5hmC的分析依赖于限制性内切酶方法,而相关方法受到酶切位点限制,并且难以区分多5hmC位点的序列。
 
汪海林研究组提出利用硼酸与可葡萄糖基化的5hmC结合,发展新的基因水平5hmC分析方法。首先,采用T4噬菌体β-葡萄糖转移酶,在葡萄糖供体底物尿核苷二磷酸葡萄糖存在下,将葡萄糖基团转移至5hmC的羟基位置,从而生成葡萄糖基化5-羟甲基胞嘧啶。在此基础上,利用定量PCR分析。最终,研究人员发现硼酸可与葡萄糖基化5-羟甲基胞嘧啶中的邻二醇发生的共价作用,有效抑制聚合酶扩增反应的特点,可特异性地识别特定基因/片段中的5hmC。
 
业内专家表示,该方法不受酶切位点限制,可适用于各种细胞、各种序列中5hmC的分析鉴定,具有广阔的应用前景。(来源:中国科学报 陆琦)
 
 
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