10月28日，总部位于美国的非营利性私人学术研究合作组织“OpenFold联盟”发布了一款新的开源人工智能（AI）模型的“抢先预览版”，并称其性能已接近谷歌旗下DeepMind公司的生物分子结构预测AI模型AlphaFold3。该模型能够预测蛋白质三维结构。

这个新发布的模型名为“OpenFold3”，基于超过30万种分子结构以及一个包含4000余万种结构的合成数据库进行训练。它能够利用蛋白质的氨基酸序列绘制其三维结构，并模拟它们与其他分子，如药物或DNA的相互作用。截至目前，该模型的开发已花费1700万美元。

OpenFold联盟执行委员会主席Woody Sherman说，目前，该工具的功能仍无法与AlphaFold3相媲美，但他们希望尽快面向社区推出一些东西，并希望基于研究人员使用“抢先预览版”的反馈改进模型。

此次发布的“抢先预览版”仅向研究人员分享了代码，以进行测试。OpenFold联盟仍在对OpenFold3进行技术改进，并计划在未来几个月内发布完整版。与仅限学术用途的AlphaFold3不同，OpenFold3未来将向所有研究人员、制药公司开放。“这在AI 结构生物学工具的民主化方面是一个巨大的进步。”Sherman说。

“很高兴看到有更多用于模拟生物分子相互作用的开源工具出现。”美国麻省理工学院研究员Regina Barzilay说。去年年末，Barzilay和同事发布了一个类似的开放获取模型Boltz。今年初，该模型的第二个版本已经能够预测蛋白质结构，并估算它们与小分子配体结合的强度。

美国范德比尔特大学的计算生物学家Stephanie Wankowicz表示，将AlphaFold3、OpenFold3和Boltz进行比较，有助于研究人员更好梳理出“让这些算法得以运行的众多拼图碎片”，以及“对于算法的不同功能而言，哪块拼图碎片最为重要”。

目前，已有几家制药和生物技术公司表示将使用OpenFold3来设计治疗自身免疫性疾病的药物和细胞疗法，以及开发保护植物和农作物的分子。