作者:黄辛 来源:中国科学报 发布时间:2016/8/4 7:50:08
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中科院上海生科院等
揭示RNA编辑表观遗传位点的系统进化规律  

 

本报讯(记者黄辛)中科院上海生科院植物生理生态研究所李轩研究组通过对多生物物种RNA编辑事件的系统发现和分析,首次揭示了RNA编辑表观遗传位点的系统进化规律,及其主要在动物神经功能和神经发育上的作用。相关研究成果已发表于《遗传学》杂志。

为此,李轩研究组与中科院上海巴斯德所郝沛研究员、美国密歇根大学王红兵教授合作,利用果蝇7个物种构建了一个由进化上相近物种组成的模型系统,并开展特定时间跨度内A-I RNA 编辑事件的发现和进化追踪。该研究共发现了9281个A-to-I RNA编辑事件,其中5150个(55.5%)分布于2734个基因的编码区(CDS)。

进化遗传分析发现这2734个基因属于1526个同源基因家族,约占7个果蝇物种总基因家族的5%。根据CDS区内编辑位点的保守性,这5150个编辑事件被分成三种不同的类型:第一类位点发生在单基因家族基因上;第二类发生在多基因家族基因上,但位点不保守;第三类发生在多基因家族基因上,且位点保守。对这三类位点及其基因进行选择分析发现,第一和第二类位点均受到纯化选择(负选择)影响,而只有第三类位点受到正选择压力。

通过分析,科学家第一次发现了A-to-I RNA编辑在动物发育、交配等生理过程中动态变化的证据,进一步支持了三类不同编辑位点的重要功能。这些结果都指向神经系统功能,说明RNA编辑表观遗传作用的适应性主要通过神经系统功能实现。 这些研究发现揭示了由RNA编辑表观遗传机制引入的编码可塑性,而产生一类新的二分变异。

《中国科学报》 (2016-08-04 第4版 综合)
 
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