作者:黄明明 来源:中国科学报 发布时间:2013-11-21 8:36:00
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国家基因库发起国际“千种鱼转录组计划”
 
本报讯(记者黄明明)11月19日,深圳国家基因库宣布“千种鱼转录组计划”(Fish T1K)正式启动。该项目旨在解密鱼类起源、进化、生殖、发育、性别调控和免疫等活动机制,以更好应对鱼类育种、疾病防控、海洋食品安全和生物多样性保护等带来的诸多挑战。项目计划在未来3~5年内完成约1000种鱼类转录组的测序、组装工作,并构建高质量的鱼类转录组数据信息平台。
 
相对于其他鱼类转录组研究,千种鱼转录组计划规模大、学科交叉广、综合性强,在全球范围内尚属首例。
 
该项目产出的所有数据将通过国家基因库公开,以保证科学家可以实时掌握鱼类研究动态及RNA-seq测序技术的最新应用。
 
据介绍,到目前为止,仅有约10种鱼类的基因组被公开报道。此外,在NCBI公共数据库中仅有80多种鱼类转录组数据。
 
国家基因库海洋分库负责人、该项目带头人孙颖认为:“T1K项目将建立首个专门针对鱼类组学研究的全球性合作网络,并将大大深化我们对鱼类的比较生理学、生物地理学认识,促进鱼类资源医用价值的挖掘、经济和生态价值的开发,以及生物多样性保护等问题的解决。”
 
《中国科学报》 (2013-11-21 第1版 要闻)
 
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