《细胞》
组织中单细胞的全转录组规模异构体分辨空间成像
美国哈佛大学庄小威团队实现了组织中单细胞的全转录组规模异构体分辨空间成像。近日,相关研究成果发表于《细胞》。
细胞和组织的功能源于许多基因之间复杂的相互作用,系统了解这些功能,需要对单细胞进行具有高空间分辨率的异构分辨转录组分析。
研究人员引入了一种原位RNA扩增方法,并将其与原位分子杂交(MERFISH)技术相结合,以检测短RNA序列,并实现完整组织中单个细胞的全转录组规模、异构分辨空间转录组学分析。使用这种方法,研究人员在小鼠大脑中成像了约3.3万种不同的RNA,包括约2.3万个基因和约1万种同种异构体。
这些数据使系统分析区域和细胞类型特异性基因程序与基于配体-受体的细胞间通信成为可能。这些数据进一步揭示了许多基因的异构体图像具有丰富的空间多样性和细胞类型特异性,以及具有异构体特异性的大脑结构。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1016/j.cell.2026.06.027
《中国科学报》 (2026-07-30 第2版 国际)