本报讯 近日，德国、波兰等国的研究人员开发出一种能在几分钟之内预测蛋白质“糖衣”形态的计算方法。这有助于进一步了解蛋白质在健康和疾病中的作用，助力药物与疫苗研发。相关研究成果发表于《细胞》。

人体细胞75%以上的蛋白质表面都覆盖着一层“糖衣”，这是由糖类分子在蛋白质周围形成的动态保护层。然而，由于糖的流动性和多变性，科学家很难确定“糖衣”的形态。

联合团队开发了这种名为GlycoSHIELD的新算法，可以快速且逼真地模拟蛋白质表面的“糖衣”。他们创建并分析了一个包含几千种三维形态“糖衣”的数据库，通过长时间的模拟和实验，发现当附着的糖未与膜或蛋白质发生碰撞时，就可以对“糖衣”形态进行可靠的预测。他们还利用GlycoSHIELD揭示了镇静剂和麻醉剂重要靶点GABAA受体上的“糖衣”形态。

研究团队表示：“我们的算法减少了所需的资源、计算时间和专业知识。现在，任何人都可以在几分钟内利用个人计算机计算蛋白质上糖分子的排列和动力学，而无须专业知识和高性能计算机。只需指定蛋白质和糖的连接位置，我们的软件就会在蛋白质表面以最可能的排列方式将它们拼出来。”（王兆昱）

相关论文信息：

https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.01.034