论文标题：The Middle Ear Microbiota in Healthy Dogs Is Similar to That of the External Ear Canal

论文链接：https://www.mdpi.com/2306-7381/10/3/216

期刊名：Veterinary Sciences

期刊主页：https://www.mdpi.com/journal/vetsci

引言

中耳炎在犬只复发性外耳炎病例中的检出率高达52%–82.6%，但临床始终缺乏“正常中耳菌群”的参照标准。由于鼓膜是否完整、外耳道与中耳微生物是否一致等问题尚无定论，治疗常陷入“经验用药—耐药—手术”的恶性循环。比利时列日大学一项最新研究首次利用16S rRNA高通量测序，描绘了健康比格犬鼓室泡（TB）的细菌地图，并与同一动物的外耳道（EEC）进行直接比对，为后续精准用药提供了空白对照。

研究内容

本研究以 12 只无耳病及皮肤病史的健康实验比格犬为研究对象，所有犬只均在与本研究无关的原因下安乐死，并经伦理委员会批准。样本采集于犬只死后 6-12 小时内，通过全耳道切除术和侧鼓室切开术，在无菌条件下分别采集每只犬左右耳的外耳道（EEC）和鼓室（TB）样本。

为确保研究对象的健康状态，排除亚临床感染，研究人员对样本进行了细胞学检查和细菌培养，最终 6 只 2 岁雄性比格犬的 12 只耳朵因检查结果阴性被纳入后续分析。研究采用 16S rRNA 基因扩增子测序技术，对细菌 V1-V3 高变区进行测序，结合 Mothur 软件和 SILVA 数据库进行序列处理与分类学注释，通过 Chao1 丰富度指数、Simpson 均匀度指数等指标分析菌群多样性。

研究结果

研究结果显示，健康比格犬的外耳道和鼓室菌群在 α 多样性和 β 多样性上均无显著差异（Chao1 指数 p=0.6544，Simpson 均匀度指数 p=0.4328，reciprocal Simpson 指数 p=0.4313）。在门水平上，两者均以厚壁菌门（Firmicutes）为优势菌门，其次为变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes），共检测到 24 个菌门。

在属水平上，外耳道中丰度较高的属包括 Turicibacter 属、乳杆菌属（Lactobacillus）、大肠杆菌 - 志贺菌属（Escherichia-Shigella）等；鼓室中则以乳杆菌属、大肠杆菌 - 志贺菌属、Turicibacter 属为主，整体菌群构成高度相似。值得注意的是，研究发现犬只左右外耳道的 Chao1 丰富度指数存在显著差异（p=0.009），推测环境因素或个体习惯可能对单侧耳部菌群产生影响。

研究意义

该研究首次通过高通量测序技术证实健康犬中耳与外耳道菌群具有相似构成特征，这与人类中耳菌群的研究结果存在明显差异。研究推测，犬类鼓膜可能存在暂时性通透性，使得外耳道细菌可下行定植于中耳，形成相似的菌群结构。

这一发现为临床治疗提供了重要实践指导：基于健康犬两者菌群相似的特征，临床中可参考外耳道菌群检测结果制定中耳感染治疗方案，有助于提高抗生素使用的精准性，减少治疗失败风险，降低手术干预的必要性。同时，研究也指出环境条件、个体遗传特征等可能影响菌群构成，为后续开展更广泛样本量、多品种犬只的研究奠定了基础。

尽管本研究存在样本量较小、仅涉及单一品种犬只等局限性，但仍填补了健康犬中耳菌群研究的空白，为犬类中耳炎的预防和治疗提供了全新的科学依据。未来，扩大研究范围、深入探索菌群与耳部疾病的关联，将进一步推动犬类耳部疾病诊疗水平的提升。

对来自 6 只健康比格犬的 12 只耳朵的外耳道和鼓室进行非度量多维尺度分析 (NMDS)。使用 AMOVA 分析未观察到实验比格犬的外耳道和鼓室之间存在显著聚类（红点，外耳道；黑点，鼓室）

Veterinary Sciences 期刊介绍

主编：Patrick Butaye, Ghent University, Belgium; City University of Hong Kong, China

发表与兽医科学领域相关的原创研究文章、评论、通讯和简短说明，主题包括动物疾病、紊乱和损伤的预防、诊断和治疗。