作者:郝东云等 来源:《基因组蛋白质组与生物信息学报》 发布时间:2021/8/17 13:19:40
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250份大豆种质材料全基因组重测序

 

大豆是当今世界五大主栽作物之一,也是人类和动物油脂和蛋白质的主要来源。挖掘大豆复杂性状的关联基因和解析性状耦合的遗传网络,对大豆分子设计育种具有重要意义。

近日,吉林省农业科学院郝东云团队联合中国农业大学王向峰团队在《基因组蛋白质组与生物信息学报》(GPB)在线发表研究论文,对250份大豆种质材料进行了深度全基因组重测序和生物信息学分析,构建了大豆性状耦合的遗传关联网络。

该研究从中国东北大豆核心种质库中收集到 250个代表性大豆种质,其中包括来自中国东北和西北地区的 134个材料,以及来自欧洲和北美地区的116个材料。研究人员对这 250个大豆种质进行了深度全基因组重测序和生物信息学分析,为进一步探索大豆的起源进化和分子设计育种提供了独特的参考。

该研究解析了全球250个代表性大豆种质的群体结构和遗传分类,鉴定了370个与大豆改良相关的强选择信号,这些选择信号大部分位于与产量和品质性状相关的基因组区域。研究支持大豆遗传水平的亚群划分与其地理分布的强相关性,支持大豆的中国起源以及大豆从地方种到栽培种的驯化路径。

研究同时对50个农艺性状进行全基因组关联分析,定位了201个QTLs,除了鉴定到如株高性状相关的Dt1、油分性状相关的 FAD2 和 SAT1等已知基因外,还确定了5个新的大豆分子设计育种关键候选基因,分别是与异黄酮含量相关的GSTT1、GL3 和 GSTL3,与产量性状相关的CKX3,以及与株型和产量性状相关的CPY85A2。

此外,该研究还构建了包括了株型、颜色、油分、异黄酮、蛋白质和产量六大类、34个性状和 853个基因的遗传网络,其中15个枢纽节点中包含367个一因多效基因。在这个网络中,同一类性状在整个网络中有更紧密的关联;不同类别的性状也会通过枢纽节点产生关联。枢纽节点中的关键基因可作为性状耦合的遗传基础,为分子设计育种提供理论依据。

综上,这项研究为大豆分子设计育种提供了重要的理论基础,对高产优质大豆品种的培育具有重要参考价值。(来源:中国科学报 王方)

相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.gpb.2021.02.009

 
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