作者:江庆龄 来源:中国科学院上海药物研究所 发布时间:2024/4/13 21:45:32
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免费开放!靶向EGFR突变肺癌的新型用药推荐平台

 

近日,中国科学院上海药物研究所研究员朱维良/徐志建团队、上海市肺科医院副教授谢冬团队和南京医科大学第一附属医院丁颖团队合作,构建了表皮生长因子受体(EGFR)突变患者临床用药数据库和EGFR突变药物敏感性预测模型,有望辅助临床医生设计合理可靠的个体化治疗方案。相关研究发表于《生物信息学简报》。 

EGFR是研究最为广泛的肺癌驱动基因之一,也是开发治疗非小细胞肺癌靶向药物的重要靶标。随着基因测序方法的发展,许多临床意义不明的新型EGFR突变类型被陆续鉴定出来,给这类突变患者的个体化精准医疗带来了新的挑战。 

研究团队收集了近二十年EGFR突变肺癌患者的临床治疗相关文献,并由此构建了EGFR突变患者临床用药数据库D3EGFRdb。结合临床案例分析结果,研究团队采用DeepPurpose库构建了80种不同编码器组合的深度学习模型并进行筛选,将17种模型进一步应用于D3EGFRdb临床数据集。结果表明,当药物编码器为Morgan、突变蛋白编码器为CNN时,综合预测效果最佳,研究团队将其作为最终模型,并命名为D3EGFRAI。在此基础上,研究团队构建了D3EGFR在线平台,该平台向所有用户免费开放,可为用户提供EGFR突变患者的病例检索和临床药物响应预测服务。

靶向EGFR突变肺癌的用药推荐平台D3EGFR 图片来源于《生物信息学简报》

相关论文信息:https://doi.org/10.1093/bib/bbae121

 
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