中山大学海洋科学学院教授卢建国团队与江西省九江市农业科学院合作，在鳤种质资源解析研究方面取得重要进展，成功组装了极危物种鳤的染色体水平基因组，首次获得鳤染色体水平的高质量基因组和注释信息。12月19日，相关成果发表于《科学数据》（Scientific Data），并被《科学引文索引》（SCI）收录。

鳤样品采集照片。梁轩广 供图

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论文共同第一作者、中山大学海洋科学学院梁轩广表示，鳤曾是我国重要的淡水经济鱼类，广泛分布于长江流域，由于环境恶化和人类活动的影响，数量急剧下降。在《中国脊椎动物红色名录》和《中国生物多样性红色名录——脊椎动物卷》中均被列为“极危”等级。

随着长江十年禁渔计划的实施，2020年12月，在长江公安段发现了7条鳤鱼个体，这是自2017年6月和2020年11月以来第3次观察到该物种，也是近年来首次记录到多个鳤鱼个体的实例。鳤的再次出现为保护工作的开展提供了机会。

该研究基于PacBio、Hi-C与转录组测序技术，完成了鳤染色体级别的基因组精细组装工作，其基因组的评估指标BUSCOs 达到 98.3%，且对基因组共预测出28,674个蛋白质编码基因，其中28,637个基因（99.87%）得到了功能注释，表明鳤的组装质量良好。

“我们实现了鳤基因组信息的首次发布，对于理解遗传多样性、识别独特适应性以及制定有效的保护策略至关重要。”论文共同通讯作者卢建国表示，研究表明鳤基因组组装在完整性与准确性上均达先进水平，为后续研究筑牢基础。

据介绍，接下来，卢建国团队将致力于开展鳤人工繁殖、养殖技术研究，力争实现鳤的可持续人工保种，助力水生生物资源保护高质量发展。

相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41597-024-04223-x