作者:田瑞颖 来源:中国科学报 发布时间:2023/4/12 17:57:23
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科学家研发出超高灵敏度定量蛋白组学标记试剂

 

近日,厦门大学药学院副教授高祥团队与广东磷基生物科技有限公司等合作开发出了基于磷化学技术的超高灵敏度蛋白定量策略(iSIPL),该技术能够实现超高灵敏度鉴定中低丰度的蛋白,尤其是低丰度的痕量蛋白,且同时兼具高通量、大规模蛋白质组的定性定量鉴定能力。相关研究成果发表于《德国应用化学》。

基于质谱平台的蛋白质组学是生命科学领域的热门核心技术之一,蛋白组学中的蛋白质深度覆盖和精确定量问题一直是困扰技术发展的难题。在蛋白组学产业化方面,由于国外研究较早,发展较快,尤其是美国和欧洲,在全球范围内处于绝对领先地位,质谱设备和相关试剂等关键技术被外资Thermo fisher、Bruker、Danaher(ABsciex)等企业垄断,成为制约我国蛋白组学发展的关键技术。

在“iSIPL”试剂发明之前,在质谱平台的蛋白质定量上,广泛应用的技术主要有Thermo Fisher的“TMT”试剂和Danaher(ABsciex)的“iTRAQ”试剂。在这项研究中,100ng的标准Bovine Serum Albumin (BSA) 蛋白,“iSIPL”试剂能鉴定出48个相关肽段,而“TMT”试剂仅鉴定出31个;同时在1ug Hela细胞体系,同样的实验条件下,“TMT”鉴定出1259的情况下,“iSIPL”能够鉴定出1397种蛋白,但在蛋白种类的差异上,“iSIPL”试剂鉴定到TMT试剂鉴定不到的515种蛋白。

研究人员还发现,“iSIPL”试剂在500ng以下,效果普遍超出“TMT”蛋白鉴定总数1倍以上。丰度越低,“iSIPL”试剂鉴定效果越好,尤其适用于低丰度蛋白,信号通路蛋白和单细胞蛋白质组学的定性定量。同时iSIPL试剂和TMT试剂相互之间,是很好的补充和相互增强,两者的联用能够进一步提高生物样本蛋白的鉴定深度。

研究人员表示,“iSIPL”试剂作为精准定量和高通量获得蛋白组数底层数据的技术,将在后基因组时代揭示基因功能,推动临床蛋白质组学的发展方面发挥重要作用。

相关论文信息:https://doi.org/10.1002/anie.202303656

 
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