作者:李晨 陈旭 来源:中国科学报 发布时间:2023/2/17 15:44:18
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接近完整:高质量白菜基因组图谱发布

 

近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所分子育种创新团队研究获得接近完整组装的白菜基因组,揭示白菜着丝粒的快速进化特征。相关研究成果在线发表于《植物生物技术》(Plant Biotechnology Journal)。

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大白菜       中国农科院供图

白菜是世界上栽培历史最悠久的蔬菜作物之一,是我国栽培面积最大的叶用蔬菜。作为芸薹属作物中第一个完成基因组测序的物种,白菜参考基因组为白菜作物的基因组研究和遗传改良奠定重要基础。但是,目前的白菜参考基因组仍然存在几百个缺口,其10条染色体的着丝粒结构组装均不完整。

该团队利用三代测序技术,获得接近完整的白菜基因组。该基因组填补了白菜基因组中绝大多数缺口,完成了8条染色体从端粒到端粒的完整组装,仅有2条染色体仍存在一个缺口。该基因组是目前组装最为完整的白菜基因组。

进一步研究发现,着丝粒区域长末端重复序列的平均插入时间为14万年,显著晚于泛着丝粒区域,表明白菜的着丝粒区域经历着快速进化。

该研究得到国家重点研发计划、中国农业科学院科技创新工程项目等项目的支持。

相关论文信息:https://doi.org/10.1111/pbi.14015

 

 

 
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