作者:朱汉斌 来源:中国科学报 发布时间:2023/11/17 20:39:39
选择字号:
猪大规模复杂性状遗传解析方面取得新进展

 

华南农业大学动物科学学院教授李加琪/张哲团队联合丹麦奥胡斯大学助理教授房灵昭、中国农业大学教授丁向东等科研人员在猪大规模复杂性状遗传解析方面取得新进展,他们成功构建了猪大规模复杂性状遗传解析数据库PigBiobank(http://pigbiobank.farmgtex.org/)。近日,相关成果发表于《核酸研究》。

精准解析猪复杂性状对了解动物复杂性状遗传调控机制和提高猪群生产性能意义重大。然而,当前以猪复杂性状为核心的综合性数据库匮乏,极大地限制了不同领域科学家对猪复杂性状遗传机制的深入探索。

为帮助更多领域科学家精准解析猪复杂性状,PigBiobank收集了来自全球71885头猪的264个复杂性状全基因组关联分析结果、PigGTEx项目产生的猪34个组织5类分子数量基因座结果、Ensembl等多种来源的猪多组学数据以及UKBiobank等跨物种复杂性状数据,并对这些大数据资源进行统一的整合分析和可视化,进而形成了以猪复杂性状为核心的综合性数据库PigBiobank。

据了解,当前版本的PigBiobank数据库中涵盖了猪复杂性状相关的丰富的数据,包括:猪264项全基因组关联研究的1371288个显著位点、猪34个组织5种分子表型的161680个全转录组关联分析显著位点、40978个孟德尔随机化显著关联结果、30347个共定位分析显著关联结果,以及复杂性状显著位点的富集分析和基于统计量的遗传参数等。

PigBiobank网站提供了包括性状、基因、基因组变异和基因组区域在内的4类查询入口和用户友好的查询界面,同时还提供PheWAS、Cross-Species comparison等在线分析工具。作为猪遗传育种领域重要的公共资源和PigGTEx联盟的重要工作之一,PigBiobank将得到持续的更新,为全球研究者持续提供猪复杂性状相关的大数据支撑。

相关论文信息:https://doi.org/10.1093/nar/gkad1080

 
版权声明:凡本网注明“来源:中国科学报、科学网、科学新闻杂志”的所有作品,网站转载,请在正文上方注明来源和作者,且不得对内容作实质性改动;微信公众号、头条号等新媒体平台,转载请联系授权。邮箱:shouquan@stimes.cn。
 
 打印  发E-mail给: 
    
 
相关新闻 相关论文

图片新闻
科学网APP推出论文&基金全新活动 冰表面长啥样?原子级分辨图像揭晓答案
北方中纬高频雷达网发布首批科学探测结果 “双星计划”:开启中国空间科学新纪元
>>更多
 
一周新闻排行
 
编辑部推荐博文