作者:朱汉斌 来源:中国科学报 发布时间:2022/5/14 17:43:49
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象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展

 

中国科学院华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队,在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究发表于Gigascience。王梓维为该文第一作者,John Seymour Heslop Harrison和刘青副研究员为通讯作者,华南植物园教授葛学军和法国农业科学中心教授Mathieu Rouard参与该项工作。

象腿蕉是芭蕉科中耐寒的蕉类植物,原产于中国云南和东南亚地区,具有重要的观赏、饲用和药用价值。研究人员采用单分子纳米孔、Illumina测序策略,结合染色体构像捕获技术,发表了首个象腿蕉染色体级别的基因组序列,长度为481.5 Mbp,完整性较高(BUSCO 98.3%),注释获得36,836个编码基因,重复序列约占基因组的55%。

象腿蕉与芭蕉属代表物种的比较基因组学研究发现,象腿蕉的长末端重复序列的组成及其插入时间,与芭蕉科其他物种均有差异,芭蕉属比象腿蕉属有更多Copia,象腿蕉LTR插入时间(峰值3.5–5 Mya)比芭蕉属物种(峰值2 Mya)更古老,还发现芭蕉科在9和11染色体基数进化过程中复杂多样的染色体重组事件。该研究结果为蕉类作物保育和改良提供重要的基因组资源。

该研究工作得到了华南植物园海外知名学者项目、国家自然科学基金、广东省基础与应用基础研究基金的资助。

相关论文信息:https://doi.org/10.1093/gigascience/giac027

 
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