作者:辛雨 来源:中国科学报 发布时间:2021/12/7 15:26:39
选择字号:
动物全物种基因组测序仍有很大空白

 

近日,美国华盛顿州立大学领导的一项研究发现,目前对动物基因组进行的测序多数集中在与人类相似的动物上,研究人员警告称,该现状可能会忽视大量的生物多样性和机会。相关研究结果发表于美国《国家科学院院刊》。

研究人员分析发现,近3300种动物的基因组已被测序。虽然动物物种测序工作一直在进行,但与世界上166万种动物物种相比,这个数字还是很小的,而脊椎动物在目前的序列中占了绝大部分。数据显示,尽管脊椎动物只代表了3.9%的动物物种,但却占测序数据集的54%。相比之下,代表78.5%物种的节肢动物门无脊椎动物(包括昆虫和蜘蛛),只占当前数据集的34%。

“随着基因组数据集的迅速积累,我们会思考我们的努力在哪里,目前数据集并不是均匀分布在动物生命树中。”研究作者、华盛顿州立大学博士后研究员Scott Hotaling认为,无脊椎动物仍然非常缺乏代表性,因为人们似乎更关心脊椎动物,即所谓的“魅力巨型动物”。

类人猿和人类拥有最接近的基因组数据,但人类基因组并不是最大的,在目前所测的动物基因组中,澳大利亚肺鱼拥有最大的基因组。

“我们对自己感兴趣,这未必是件坏事。”研究通讯作者、杨百翰大学助理教授Paul Frandsen表示,要开始了解整个生态系统,必须开始对更多的生物进行采样,以获得更清晰的了解。脊椎动物是生态系统的重要组成部分,但昆虫和许多其他小型生物可能发挥着更重要的作用,因为它们处于食物链的底断。

研究作者、华盛顿州立大学副教授Joanna Kelley还指出,目前绝大多数基因测序工作发生在发达国家,且大多数国家位于北半球,不同地区的测序工作也有特定的倾向。例如,北美国家对哺乳动物和昆虫进行了最多的测序,欧洲国家对鱼类进行了较多测序,而亚洲则对鸟类进行了较多测序。

近年来,各国家机构宣布了几项大型的基因组测序工作,其中包括地球生物基因组计划。该计划设定了一个雄心勃勃的目标,在未来10年内对所有真核生物(包括动物、细菌和单细胞生物)进行测序。

截至2021年6月,已收集到3300多个动物基因组数据集。研究人员通过计算发现,以目前每天大约测序4个基因组的速度,要到3130年才能达到对所有真核生物进行测序的目标。

研究人员同时提出,促进达成该目标的一个方法是发展基础设施,并让更多来自南半球国家的研究人员参与其中,尤其是热带地区,因为热带地区的动物多样性丰富。

相关论文信息:https://doi.org/10.1073/pnas.2109019118

 
版权声明:凡本网注明“来源:中国科学报、科学网、科学新闻杂志”的所有作品,网站转载,请在正文上方注明来源和作者,且不得对内容作实质性改动;微信公众号、头条号等新媒体平台,转载请联系授权。邮箱:shouquan@stimes.cn。
 
 打印  发E-mail给: 
    
 
相关新闻 相关论文

图片新闻
研究揭示森林混交的增产效应 全球仅存的9株野生绒毛皂荚进入盛花期
波音星际飞船将飞往国际空间站 仅在2019年,全球就有900万人死于污染
>>更多
 
一周新闻排行
 
编辑部推荐博文