作者:许琦敏 来源:文汇报 发布时间:2021/11/1 9:55:51
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一场聚焦生命科学的论坛,为何数学家、物理学家、计算机科学家都来了
生命太复杂,学科融合将带来颠覆式创新

 

■本报记者 许琦敏

一场聚焦生命科学的论坛,为何数学家、物理学家、计算机科学家都来了?在昨天举行的第四届世界顶尖科学家论坛·生命科学3.0和交叉研究论坛上,“复杂”,是这些“顶尖大脑”们对生命现象的共识。无论是蛋白质还是大脑,其数量之庞大、结构之复杂,都令人类既有的研究手段显得相形见绌。

而今,各学科的大交叉、大融合,正在推动生命科学从过去描述性、定性研究阶段,向全局性、定量研究阶段发展。这一过程带来的巨大变化,甚至使年轻科学家“无需向前辈请教”,因为太多颠覆式创新可能无法预测。

“我撰写教科书《细胞生物化学》至今已有43年,但每次修订,我都感觉有很多东西还没弄明白。”2016年拉斯克医学特别成就奖得主布鲁斯·阿尔伯茨说,生命之复杂是他这辈子科研生涯中印象最深刻的事,“想要用简单的网络线路图表现清楚生命体中的信号通路,离开数学和计算工具,是难以想象的”。

事实上,早在上世纪四十年代,物理学家就已经提出了类似想法,但学科之间的融合却十分缓慢。“哪怕是最简单的细胞,也有四百多个基因,每三小时分裂一次,并通过复杂的蛋白网络协作,计算生物学在此类细胞分析研究中能起到很好的作用。”阿尔伯茨认为,更深入理解生命现象,非常需要数学、物理等学科的介入,如果离开这些工具,人类对生命本质的理解就如同“用小学一年级的词汇与思维去理解莎士比亚作品”一样茫然。

他呼吁,青年科学家不要“赶时髦”,应踏踏实实做好基础研究。阿尔伯茨展示了一张照片,“我的研究团队成员来自各个不同国家,但我们一起工作”。他认为,生命科学需要更多的开放,与更多学科融合,才能最终破解生命之谜。

2020年图灵奖得主阿尔弗雷德·艾侯认为,计算生物学将生物、化学、计算机、医学、物理、哲学等融合在一起,“它还有潜力融合更多学科”。最初的编码器由IBM公司花费了18年才完成,而现在,一个计算机专业博士生就能开发出一个。在算力呈几何级增长的当下,计算生物学必将推动生命科学进入一番新天地。

2013年诺贝尔生理学或医学奖得主詹姆斯·罗斯曼也十分善于“跨界”,他早年学物理,又学过医学,然后转向生命科学。从年轻时开始,他就喜欢尝试将不同学科知识融会贯通来解决实际问题。13年前,他出任耶鲁大学细胞生物学系系主任,就大量招收不同学科背景的年轻学者,以拓宽研究领域,营造学科交叉的氛围。

“在同一个系,有十几名年轻教授都在从事同一方向研究,比如光镊、单分子工具等,结果非常成功。”在罗斯曼看来,把研究路径设得太明确不是一件好事,只有不断互动,年轻科学家才能不停成长。

毋庸置疑,生命科学发展受益于学科交叉融合。浙江大学求是讲席教授周如鸿说,工业革命后,生命科学发生了两次革命:第一次是从DNA双螺旋结构到分子生物学,第二次是从分子生物学到基因组学,两次革命都是数学、物理、计算机科学与生命科学交叉融合的巨大成果。接下来的第三次生命科学革命即21世纪的新生物学,将实现从观察性、定性到定量、可预测性的转变,是生物学与定量科学和工程的交叉融合。

然而,在1994年菲尔兹奖得主埃菲·杰曼诺夫看来,生命科学在21世纪的发展,很可能会成为数学学科发展的动力源泉之一。“在十六、十七世纪,物理学的发展曾为推动数学作出过很大贡献,在21世纪,很可能是生命科学。”

事实上,生命科学研究遇到的大量问题,正在推动包括人工智能在内的各种工具的发展。复旦大学教授马剑鹏表示,目前蛋白质动态维度研究正迎来最好时机,蛋白质结构可通过实验或计算机预测来确定,但动力学性质只能通过计算机模拟来实现。上海纽约大学教授张增辉认为,尽管“阿尔法折叠”等机器学习方法实现了精准预测蛋白质三维结构,但仍有不少提升空间。

 
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