北京大学系统生物医学研究所于6月17日宣告成立。全国人大常委会副委员长、北京大学医学部主任韩启德出席研究所成立大会并题辞"问题导向，学科交叉，克服浮躁，追求原创"。
北京大学基础医学院院长
尹玉新教授任该所所长。据尹玉新介绍，系统生物学是研究一个生物系统中所有组成成分（基因、mRNA、蛋白质等）的构成，以及在特定条件下这些组分间的相互关系，并通过计算生物学建立数学模型来定量描述和预测生物功能、表型和行为的学科。系统生物学使医学具有预测性、预防性和个性化，在医学方面的应用包括三方面：寻找新途径预测个体对特定疾病的敏感性；寻找对于各种疾病更为有效的诊断和治疗途径；为每个人提供维持健康和预防疾病的个性化方案。系统生物学在药学方面已用于新药的发现和开发，它可缩短药物发现的进程，促进靶点的发现与确认，加速标志物的发现，有利于疾病的诊断和跟踪临床疗效，有助于确立个性化用药方案和评价药物的毒副作用，做到用药安全化。
北京大学系统生物医学研究所的研究方向是：重大疾病，如肿瘤、心脑血管疾病、代谢性疾病等的系统生物学研究。其发展目标是：将研究所建成一个可以从基因、蛋白、分子、离体器官、整体动物、临床同时开展系统生物医学研究的，具有国际一流水平的国家级研究基地，最终从整体水平揭示肿瘤、心脑血管疾病等重大疾病的发病机理及治疗措施，实现预测医学、预防医学和个性化医学。
根据上述研究目标，该所首期将设置以下8个研究室：
1. 基因组学研究室：用系统生物学的方法对全基因组的结构和功能进行全面研究，探索基因变异与疾病的联系；
2. 蛋白质组学研究室：主要研究细胞生物体内蛋白质群组成，相互作用及其在时间空间上的活动规律；
3. 代谢组学研究室：通过分析体液或组织测定整个机体的系统代谢图谱和功能调控，研究代谢规律和疾病发生的关系；
4. 计算生物医学研究室：用现代计算方法整合分析生物实验数据，构造并完善系统数学模型；
5. 分子遗传研究室：主要运用分子遗传学方法对肿瘤、心脑血管疾病等的发病机理、预防诊断及治疗进行研究；
6. 结构生物学研究室：通过研究生物大分子特定空间结构与其生物学功能的关系，阐明蛋白质结构与功能的关系；
7. 药物研发研究室：应用系统生物学的手段，发现并鉴定重大疾病，如肿瘤、心血管疾病等的药物靶点，筛选并优化先导化合物；
8. 转化医学研究室：将基础研究与临床实践紧密结合，以疾病为先导，用基因组学、蛋白组学、代谢组学的方法, 探索中西医药网络调控作用，为复杂疾病的综合治疗提供支撑。
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