《自然》

营养胁迫条件下核糖体库系统定量分析

美国哈佛医学院J. Wade Harper研究小组的一项最新研究探索了营养胁迫条件下核糖体库的系统定量分析。相关论文7月1日在线发表于《自然》。

研究人员将定量翻译组和降解组蛋白质组学与遗传编码的Ribo-Keima和Ribo-Halo报告基因整合在一起，以研究在有或没有主动自噬情况下r蛋白的稳态。在急性营养胁迫条件下，细胞会强烈抑制r蛋白的翻译，但值得注意的是，r蛋白降解主要通过非自噬途径发生。同时，r蛋白质丰度的降低可以通过减少预先存在核糖体的浓度以及减少细胞体积来弥补，从而保持单个细胞内核糖体的密度。

减少碱性或疏水性氨基酸可诱导翻译抑制，而不会引起核糖体自噬的差异诱导，这表明在急性营养胁迫期间，核糖体自噬未用于选择性地产生碱性氨基酸。

相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41586-020-2446-y

《细胞—代谢》

肠道微生物为肝硬化诊断提供便利

美国加州大学Rohit Loomba和索尔克生物研究所Ronald M. Evans研究组合作取得进展。他们揭示了可以预测肝硬化的通用肠道微生物组特征。这一研究成果近日在线发表于《细胞—代谢》。

为了确定肝硬化诊断与肠道微生物的相关程度，研究人员比较了包括非—非酒精性脂肪性肝（NAFLD）对照、NAFLD肝硬化患者及其直系亲属在内的163名特征明确参与者的粪便微生物组。通过使用随机森林机器学习算法结合鸟枪法宏基因组学和非目标代谢组学谱的差异丰度分析，研究人员发现离散的宏基因组学和代谢组学特征在检测肝硬化方面同样有效。

将宏基因组学特征与年龄和血清白蛋白水平相结合，可以准确地区分在地理上分离区域病因和遗传上不同人群的肝硬化。肝硬化患者的血清天冬氨酸转氨酶水平增加，这可以区分肝硬化和早期纤维化。

相关论文信息：https://doi.org/10.1016/j.cmet.2020.06.005

《细胞》

研究绘制人类端脑发育过程中的染色质可及性图谱

近日，《细胞》在线发表了美国加州大学旧金山分校John L. Rubenstein、Katherine S. Pollard等研究人员的合作成果。他们绘制了人类端脑发育过程中的染色质可及性图谱。

为了发现在大脑发育过程中不同类型细胞以及区域中调节基因表达特异性的调控元件，研究人员从妊娠中期人类端脑的九个解剖区域以及显微解剖的前额叶皮层上层和深层中产生了开放染色质图谱。研究人员确定了一类开放的染色质区域，被称为预测的调控元件（pRE），它们很可能充当大脑发育的增强子。pRE在染色质可及性方面表现出时间、区域和层次的差异，并且与区域和胎龄之间的基因表达差异相关。

相关论文信息：https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.002