来源:Genome Biology 发布时间:2020/4/29 13:15:33
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Genome Biology | 在愈发紧密的连接中开放与分享数据

论文标题:Open data in a deeply connected world

期刊:Genome Biology

作者:Barbara Cheifet

发表时间:2020/04/20

DOI:10.1186/s13059-020-02010-6

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新冠疫情之下,全球科研机构受到巨大冲击,同时也迎来机会与挑战并进的时代。这个全球化时代,科研工作者们包括很多基因组学研究学者,已经通过共享数据在短时间内推动我们对SARS-CoV-2以及新型冠状肺炎的了解,Genome Biology 希望借此机会表达对疫情相关数据开放的支持,以及我们对整体基因数据开放的坚定立场。

© Rido / Fotolia

Genome Biology 主编Barbara Cheifet在4月20日发表的社论里重申期刊在开放数据开放代码上的一些立场:

• 科研工作的是一个开放流动的过程。论文发表并不代表终结,所以数据开放以及代码开放既能促进同行评审的全面性,又能保证论文发表以后科学同行之间可重复性验证以及其他交流沟通;

• 期刊认同的数据库存储清单具体遵循(https://www.nature.com/sdata/policies/repositories#general)。这是因为INSDC在数据分享数据维护上有着较长的历史,一直维护着比较稳定的数据分享准则;

• 期刊了解一些中国的大型数据库并不在此清单上。在维护个体隐私及国家安全的基础上,期刊希望这些数据库能继续与INSDC的沟通与合作,完成进入INSDC的过程;

• 在此之前,期刊暂不接受上述清单之外的数据库作为数据开放的唯一来源。我们理解这对一些特殊地区(包括中国与欧洲一些国家)的科研作者们带来了不便,我们希望作者们能在启动科研项目的时候就考虑到数据开放的问题,查询自己所在区域的数据开放规章制度,做好备案,找到合适的数据库并建立数据投放渠道;

• 预印本已经深深影响了科学发展。特别是这次疫情之中,一些预印本工作在经过同行评审之前已经被媒体大量误读,并引发深刻的社会效应。期刊长久以来一直支持预印本的分享,并鼓励送审文章在见刊之前在预印本平台上与大家分享。但是我们也看到同行评审是一个科学研究中不可或缺的部分,这使我们更坚定地希望审稿人们能对原始数据原始代码进行尽责地分析评定。

大数据和全球化时代,信息分享看似更简便,但完成负责任且有益的信息分享并非易事。Genome Biology 希望今后能有机会接受更多的数据分享平台作为有效的数据与代码分享渠道,编辑们也十分乐意接受作者们随时垂询数据开放事宜。

(来源:科学网)

 
 
 
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