作者:Curtis Huttenhower 来源:PNAS 发布时间:2015/6/2 11:37:52
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人体微生物可用于身份识别
科学家指出亟须关注由此涉及的隐私问题

 

人类粪便细菌中的DNA 能够被用来鉴别个体身份。图片来源:Eye of Sciencebrary

姑且叫它“肠道印章”吧——研究人员发现,人体内的微生物脱氧核糖核酸(DNA)能够用来识别一个人的身份,当然这里还涉及一些隐私问题。

研究人员在5月11日出版的美国《国家科学院院刊》上报告了这一研究成果。这一发现意味着它能够在一项匿名的有关人体微生物组的研究中鉴别参与者,并揭示一个人的健康、饮食或种族的详细信息。与此同时,根据一项4月29日发表在《基因组研究》杂志上的成果,由美国国立卫生研究院(NIH)维护的一个公开可用的微生物组DNA库已经包含了潜在的可识别人类DNA。

主持这项最新研究的马萨诸塞州波士顿哈佛T.H.Chan公共卫生学院计算生物学家Curtis Huttenhower表示:“目前,微生物组的数据管理多少有一点‘狂野西部’的感觉。”他说:“随着这一领域的发展,我们需要确保有一个共识,即我们的微生物组是非常独特的。”

人类基因组研究人员多年来一直在设法解决隐私问题。2013年,科学家表示,他们通过交叉引用包含了年龄、住所和姓氏的一个家谱数据库中的DNA,从而确定出匿名参与国际“1000基因组”项目的5名受试者的名字。

近些年来,微生物组对人类健康和行为的影响逐渐成为热点研究领域。来自人类微生物组研究的数据最终往往会储存于公共数据库中,但尚不清楚这些微生物组是否能够被用来永久识别这些个体。

这项研究的第一作者、哈佛大学生物学家Eric A. Franzosa和同事开发出一种电脑算法,为美国“人类微生物组计划”招募的120人建立粪便、唾液和皮肤等样本的微生物个人识别码,即所谓微生物“指纹”,并将其与跟踪随访中获得的样本及另外一组志愿者的样本进行比较。结果发现,每个人都拥有独特的微生物“指纹”,而且大部分人的微生物“指纹”在为期一年的调查期间保持稳定。

研究人员发现,粪便样本的微生物“指纹”尤其可靠,即便时间过去一年,仍能正确识别约80%的志愿者,这显示肠道微生物组比较稳定。皮肤样本则较不可靠,时隔一年后只能正确识别约三分之一人的身份。

不过,研究人员也警告说,微生物“指纹”可能带来隐私问题,比如在没有当事人同意的情况下,暴露出感染性病等敏感的个人信息。

Franzosa在一份声明中说:“把人类DNA样本与人类DNA‘指纹’数据库进行关联,是法医鉴定遗传学的基础。我们的研究显示,无须人类DNA,利用人体微生物的DNA序列也有可能形成同样的关联。”(来源:中国科学报 赵熙熙)

 
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