作者:宋林生 来源:《DNA研究》 发布时间:2014-8-22 11:25:41
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绘制菊黄东方鲀基因组草图

 

近日,中科院海洋所研究员宋林生带领团队绘制完成菊黄东方鲀基因组草图。相关成果发表于《DNA研究》杂志。

菊黄东方鲀俗称“满天星”,在亚洲有着悠久的食用历史和极高的经济价值,也是我国重要的河鲀养殖品种之一。科研人员依托中科院海洋所自主构建的海洋生物基因资源平台和超算平台,独立完成了菊黄东方鲀全基因组的测序、拼装及分析,并利用相关第二代高通量测序仪,测序得到总长度为76千兆的序列。

研究发现,菊黄东方鲀基因组在GC含量和重复序列等多个方面与红鳍东方鲀基因组相似,菊黄东方鲀基因组中共有30285个蛋白编码基因,蛋白平均长度为519.9个氨基酸。

专家表示,该项研究积累了东方鲀属鱼类的遗传背景资料,为深度发掘海洋动物功能基因、开展蛋白功能的高效验证分析奠定了基础。(来源:中国科学报 彭科峰)

 
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