作者:Rashid Bashir 来源:《科学报告》 发布时间:2013-3-18 10:20:06
选择字号:
研究开发出甲基化DNA新单分子检测技术
 
Mayo诊所与Illinois大学的研究人员合作,开发出了一种检测甲基化DNA的新单分子检测技术,这种技术以固态的纳米孔为基础。文章发表在《自然》(Nature)旗下的《科学报告》(Scientific Reports)杂志上。
 
表观遗传学修饰可以不改变基因编码,而影响基因的开启或关闭。甲基化是表观遗传学修饰的一个重要途径,细胞通过给DNA链添加甲基来调控基因表达。真核生物的基因组中,表观遗传学修饰主要以5-甲基胞嘧啶(5 mC)的形式存在。在包括癌症在内的多种疾病中,这些修饰与转录抑制、基因表达、疾病的发生和发展有着重要关联。
 
“近年来,人们开始研究用纳米孔进行基因组测序和筛选分析。而我们的这种新技术特别适用于研究表观遗传学相关疾病,可以免除一些现有方法中的必要步骤,”该研究的共同领导者,Mayo诊所的George Vasmatzis博士说。他指出,基于纳米孔的甲基化检测技术,不需要对DNA进行重亚硫酸盐转化、荧光标记和PCR。
 
“我们采用了更薄的膜和相应的制备步骤,来提高空间分辨率”另一位研究领导者,Illinois大学的Rashid Bashir教授说。
 
在这一技术中,研究人员利用人工薄膜上的纳米级小孔,来实现对单个分子的鉴别。他们用MBD1(MBD-1x)蛋白对甲基化位点进行选择性标记。与未甲基化的DNA相比,蛋白-甲基化DNA复合体所引起的离子阻塞电流(ionic blockage current)增加了三倍。由此人们可以通过检测纳米孔的离子电流,来鉴别甲基化和非甲基化DNA。
 
研究显示,在只有一个蛋白结合的情况下,该技术也可以成功分辨甲基化和非甲基化的DNA。这说明以纳米孔为基础的单分子甲基化检测技术,可以使检测分辨率达到单个甲基化CpG二核苷酸。此外,该技术还可以对目标分子的甲基化程度进行粗略定量。
 
在绝大多数癌症中,启动子序列的甲基化能够体现肿瘤的发展情况,是比许多基因指标更具优势的生物学指标。研究人员强调,基于纳米孔的甲基化检测技术无需重亚硫酸盐转化、荧光标记和PCR,因此在研究人类疾病中的表观遗传学作用时非常有用。(来源:生物通 叶予)

更多阅读
 
 
 
 
 
特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用,须保留本网站注明的“来源”,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,请与我们接洽。

 
 
 打印  发E-mail给: 
    
 
以下评论只代表网友个人观点,不代表科学网观点。
SSI ļʱ
 
相关新闻 相关论文

图片新闻
果实变蓝 吸引鸟类 化学家创造出最亮荧光材料
全球植物种类最丰富岛屿“家底”摸清了 新技术探测液—液界面化学过程
>>更多
 
一周新闻排行 一周新闻评论排行
 
编辑部推荐博文
 
论坛推荐