作者:William P. Hanage 来源:PNAS 发布时间:2012-2-29 14:03:39
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基因组测序法可追查疫情暴发路径
 
据美国物理学家组织网近日报道,由哈佛大学公共卫生学院和布洛德研究所共同组成的一个研究小组,利用全基因组测序已经追查到去年在欧洲大范围致病的大肠杆菌(E.coli)暴发路径。相关研究结果提前刊登在近日美国《国家科学院院刊》在线版上。
 
这是第一个采用基因组测序的方法来研究食源性暴发的动态,由此为了解未来疫情和传染病的出现和蔓延提供了新途径。这项研究的合作者还包括法国巴斯德研究所、丹麦国立血清研究所等。
 
在生物学中,一个生物体的基因组是指包含在该生物的DNA(部分病毒是RNA)中的全部遗传信息。确定哪些DNA变异导致特定性状或疾病则需要进行个体间比较。该研究的主要作者、传染性疾病动态中心研究者永纳坦·格拉德说,寻找疫情暴发的多种细菌的基因组之间的差异,即可得到疫情发生的线索。像做侦探工作一样,研究人员通过这种方式跟踪疫情,可了解未来疾病暴发路径。
 
去年夏天在德国,因大肠杆菌病毒的肆虐成千上万人生病,50多人死亡,之后在法国也引起了小范围的暴发。研究人员将这两国的致病大肠杆菌株对比分析,发现菌株相同。然而,利用全基因组测序分析菌株之间的差异时,研究人员发现:所有与德国当地相关暴发的菌株都几乎是相同的,而出现在法国菌株表现出更大的多样性,显示出是从德国菌株分离出来的一个子集。
 
随着基因组测序成本的下降,未来将其与传统的流行病学方法相结合,可以为人们对传染病的出现及蔓延提供更深入的了解,将有助于指导公共卫生预防措施。(来源:科技日报 华凌)
 
 
 
 
 
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