作者:Andreas Keller 来源:《自然—方法学》 发布时间:2011-9-15 14:54:18
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研究绘制病人血液miRNA表达谱
 
德国多个研究机构的研究人员绘制了来自病人血液的miRNA表达谱,其中包括自体免疫疾病、癌症、心血管疾病以及慢性炎症患者。该研究成果发表在9月4日的《自然—方法学》(Nature Methods)在线版上。
 
在一项多中心研究中,研究人员对患病个体的454个血液样本进行芯片分析,确定了863个microRNA的表达谱,并利用实时定量PCR验证了此miRNA组(miRNome)。他们检测了所有疾病的一致下调图谱,而通路分析证实了各个miRNA的疾病相关性。他们还发现,疾病相关遗传变异的基因组位置与下调的miRNA存在显著相关性(P = 0.004)。
 
miRNA不仅影响或者调控了细胞增殖、分化过程中的mRNA和关键蛋白质,还可能同时具有肿瘤抑制因子和原癌基因的功能,在癌症的诊断和治疗中发挥重要的作用。尽管大部分报道的miRNA表达谱都是从实体组织中产生的,但越来越多的证据表明,miRNA表达谱也可以从体液中轻松获取,比如血液。
 
于是,德国生物标志物探索中心的Andreas Keller联合其他研究人员,试图阐明并比较不同疾病中863个miRNA的血液表达谱,以检测疾病特异的改变。他们收集了454个血液样本,分别来自患有肺癌、前列腺癌、胰腺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胃癌、肾母细胞癌、胰腺肿瘤、多发性硬化症、慢性阻塞性肺疾病、结节病、牙周炎、胰腺炎或急性心肌梗塞的个体,以及未患病的对照个体。
 
研究人员使用了高度特异的引物延伸型芯片,这种芯片表现出非常低的交叉杂交,可区分let-7家族的成员。平均说来,他们在每种疾病中找到103个下调的miRNA。与对照相比,总共62个miRNA在至少6种疾病中下调,而24个miRNA在一半以上疾病中下调。一个miRNA(hsa-miR-320d)在11种疾病中下调,而三个miRNA在9种疾病中下调。大部分miNRA在多数疾病中一致下调。
 
为了研究显著下调的miRNA是否在物理位置上接近已知的易感变异体,他们提取了3495个发表的SNP,并在这些SNP周围的250 kb范围内搜索miRNA的编码序列。他们检测到241个SNP与miRNA接近的情况。其中,7个与研究中包含的疾病相关。他们发现,遗传变异的邻近与下调的miRNA存在显著相关性(P = 0.004)。
 
作者总结道,鉴定疾病与血细胞中miRNA表达谱变化之间的复杂关系,不仅有助于了解疾病关联,还为病理过程提供了线索,因为miRNA影响了数千个基因的表达。(来源:生物通 薄荷)
  
 
 
 
 
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